More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0632 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  100 
 
 
398 aa  788    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  95.23 
 
 
393 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  66.5 
 
 
426 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  65.81 
 
 
426 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  66.07 
 
 
426 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  66.49 
 
 
426 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  66.07 
 
 
427 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04730  Ornithine/acetylornithine aminotransferase  65.63 
 
 
383 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  54.15 
 
 
397 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  49.1 
 
 
395 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  48.82 
 
 
398 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  46.75 
 
 
395 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  48.05 
 
 
395 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  45.52 
 
 
397 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  47.24 
 
 
394 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  46.46 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  46.46 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
394 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  45.67 
 
 
394 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
395 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  45.27 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  45.14 
 
 
394 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
394 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
394 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
394 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  45.14 
 
 
394 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  44.88 
 
 
394 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  45.71 
 
 
399 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  42.04 
 
 
405 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  46.98 
 
 
510 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
394 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
398 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.82 
 
 
394 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
398 aa  289  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
396 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
398 aa  285  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  43.41 
 
 
398 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  38.96 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
402 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.31 
 
 
395 aa  279  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
399 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.38 
 
 
395 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.12 
 
 
395 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.53 
 
 
399 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
399 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  38.5 
 
 
385 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.61 
 
 
417 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.47 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.92 
 
 
396 aa  273  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
400 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
385 aa  270  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.04 
 
 
399 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.05 
 
 
396 aa  269  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.18 
 
 
406 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.47 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.44 
 
 
406 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.18 
 
 
406 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.13 
 
 
387 aa  264  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.42 
 
 
397 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.66 
 
 
400 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
418 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.24 
 
 
396 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.93 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 
395 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.37 
 
 
406 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.47 
 
 
406 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  38.85 
 
 
405 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.69 
 
 
404 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.11 
 
 
405 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.67 
 
 
406 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40 
 
 
404 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.47 
 
 
410 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 
403 aa  257  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.74 
 
 
406 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.8 
 
 
427 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.73 
 
 
410 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.25 
 
 
436 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.73 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  37.62 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.67 
 
 
416 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.53 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.93 
 
 
408 aa  253  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  37.75 
 
 
427 aa  252  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.47 
 
 
410 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.87 
 
 
404 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.93 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.63 
 
 
405 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.1 
 
 
405 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.21 
 
 
410 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.16 
 
 
406 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>