More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2703 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  78.12 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  95.48 
 
 		 399 aa  781    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  78.77 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  77.86 
 
 		 394 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  77.86 
 
 		 394 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  84.81 
 
 		 395 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  79.03 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  78.12 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  79.03 
 
 		 394 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  79.8 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  77.86 
 
 		 394 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  78.12 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  81.07 
 
 		 394 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  81.59 
 
 		 394 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  84.05 
 
 		 395 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  77.86 
 
 		 394 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 		 395 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  78.77 
 
 		 394 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  99.75 
 
 		 395 aa  810    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  79.03 
 
 		 394 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  78.77 
 
 		 394 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  76.98 
 
 		 394 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  78.12 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  75.71 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  76.3 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  68.8 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  62.69 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  60.36 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  54.69 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  46.19 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  46.65 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  46.39 
 
 		 426 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  46.19 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  45.85 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  45.88 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.04 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.85 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.68 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  43.52 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.62 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.34 
 
 		 394 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.56 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 		 398 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.4 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.3 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.08 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.04 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.08 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.08 
 
 		 406 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.08 
 
 		 406 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  44.81 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.81 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  44.81 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.81 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.81 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.64 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.27 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  44.41 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.78 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  46.22 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.89 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.71 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.9 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.97 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.19 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.09 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.6 
 
 		 403 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.96 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.4 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.45 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  41.6 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.4 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.4 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.4 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.48 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.62 
 
 		 406 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.15 
 
 		 401 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 		 398 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  41.69 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.13 
 
 		 405 aa  278  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.49 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  44.86 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2043  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.38 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.59 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.08 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1871  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.66 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1430  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.38 
 
 		 408 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.95 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.25 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.86 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.59 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3516  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.66 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  40.67 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.21 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>