More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1443 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  91.18 
 
 		 397 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 		 397 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  76.3 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  76.3 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  75 
 
 		 395 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  74.81 
 
 		 399 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  74.41 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  73.37 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  71.28 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  69.47 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  69.47 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  69.47 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  69.47 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  71.03 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  70.26 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  70.26 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  70.51 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  70.51 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  70.51 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  73.97 
 
 		 395 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  70.68 
 
 		 394 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  69.47 
 
 		 510 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  65.89 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  62.7 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  57.07 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  52.97 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  45.27 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  44.5 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  47.43 
 
 		 426 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.06 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  47.41 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  45.65 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.36 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  46.11 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.92 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  41.39 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.09 
 
 		 394 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.04 
 
 		 385 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.78 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.56 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.86 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 400 aa  288  9e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  43.39 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  40.97 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.04 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.48 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.54 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.28 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.28 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.28 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.1 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.42 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  42.86 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  42.86 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.77 
 
 		 406 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.67 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.78 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1628  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.51 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.95 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.98 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.82 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.98 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.98 
 
 		 414 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.99 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.77 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.33 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  37.07 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  37.07 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.84 
 
 		 397 aa  276  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.37 
 
 		 396 aa  276  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2043  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.04 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.26 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1871  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.3 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.94 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1430  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.04 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.42 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  42.59 
 
 		 401 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.22 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.6 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1415  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.3 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.38 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.79 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1398  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.78 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.126602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>