More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1725 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
397 aa  810    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  91.18 
 
 
397 aa  723    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  75.84 
 
 
399 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  75.52 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  75.71 
 
 
395 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  74.23 
 
 
395 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  74.67 
 
 
394 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  73.63 
 
 
394 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  71.54 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  69.97 
 
 
394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  69.97 
 
 
394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  71.03 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  69.97 
 
 
394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  70.77 
 
 
394 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  70.77 
 
 
394 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  71.28 
 
 
394 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  70.51 
 
 
394 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  70.77 
 
 
394 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  71.73 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  74.23 
 
 
395 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  69.72 
 
 
510 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  67.1 
 
 
395 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  63.88 
 
 
397 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  57.92 
 
 
398 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  53.23 
 
 
405 aa  411  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  45.52 
 
 
398 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  44.76 
 
 
393 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  46.08 
 
 
396 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  48.24 
 
 
426 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.7 
 
 
398 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  48.23 
 
 
426 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  46.44 
 
 
426 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.45 
 
 
387 aa  331  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  46.92 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.97 
 
 
402 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
398 aa  324  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.59 
 
 
394 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.42 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.05 
 
 
394 aa  319  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
385 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.34 
 
 
385 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.1 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 
395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.85 
 
 
406 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.85 
 
 
406 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.85 
 
 
406 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  43.44 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.33 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  43.44 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  44.07 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.33 
 
 
406 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.08 
 
 
406 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
400 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.52 
 
 
414 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 
395 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 
403 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1871  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.88 
 
 
408 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.7 
 
 
406 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1430  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.62 
 
 
408 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2043  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.62 
 
 
408 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.52 
 
 
414 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.52 
 
 
446 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.81 
 
 
399 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.42 
 
 
406 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
396 aa  294  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.9 
 
 
396 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.01 
 
 
406 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.39 
 
 
400 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1415  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.88 
 
 
408 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.19 
 
 
406 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1398  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.06 
 
 
408 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.19 
 
 
406 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.19 
 
 
406 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.19 
 
 
406 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  42.86 
 
 
405 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.75 
 
 
405 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.11 
 
 
397 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.93 
 
 
396 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  43.92 
 
 
427 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
397 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.65 
 
 
406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.45 
 
 
395 aa  289  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.42 
 
 
399 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.11 
 
 
417 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.44 
 
 
406 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.42 
 
 
408 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1628  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.82 
 
 
405 aa  285  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.16 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.56 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.96 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  42.13 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.07 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.64 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>