More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1679 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
395 aa  808    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  69.82 
 
 
394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  69.57 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  69.57 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  69.82 
 
 
394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  69.82 
 
 
394 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  69.82 
 
 
394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  69.57 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  69.57 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  68.8 
 
 
394 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  68.8 
 
 
394 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  69.57 
 
 
394 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  69.57 
 
 
394 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  69.05 
 
 
394 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  68.8 
 
 
394 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  69.05 
 
 
394 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  69.05 
 
 
394 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  69.05 
 
 
395 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  68.8 
 
 
395 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  68.35 
 
 
399 aa  551  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  67.94 
 
 
395 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  68.03 
 
 
394 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  69.82 
 
 
510 aa  541  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  67.1 
 
 
397 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  68.19 
 
 
395 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  65.89 
 
 
397 aa  521  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  64.75 
 
 
397 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  63.38 
 
 
398 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  54.29 
 
 
405 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  49.1 
 
 
398 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  48.68 
 
 
398 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  49.21 
 
 
398 aa  365  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  49.1 
 
 
393 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  48.42 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  48.47 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  49.35 
 
 
426 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  48.97 
 
 
426 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  48.59 
 
 
426 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.45 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.92 
 
 
402 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
399 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.08 
 
 
396 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
399 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  46.08 
 
 
396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
399 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
387 aa  315  9e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  46.89 
 
 
399 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  45.62 
 
 
427 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.6 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.56 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  45.57 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.1 
 
 
417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.85 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.37 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
397 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.73 
 
 
395 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 
391 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.69 
 
 
399 aa  298  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.21 
 
 
400 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
403 aa  296  5e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
396 aa  295  8e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.81 
 
 
396 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
422 aa  293  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.22 
 
 
400 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.83 
 
 
385 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.48 
 
 
397 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  41.94 
 
 
427 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.65 
 
 
406 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  43.39 
 
 
406 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
406 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.39 
 
 
406 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  41.09 
 
 
385 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.39 
 
 
406 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  43.39 
 
 
406 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.53 
 
 
394 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.99 
 
 
397 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.39 
 
 
406 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.69 
 
 
396 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.52 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.6 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.86 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  41.99 
 
 
386 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.56 
 
 
396 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.01 
 
 
411 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.9 
 
 
396 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  40.39 
 
 
423 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.77 
 
 
405 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  44.13 
 
 
403 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
427 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
387 aa  279  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
405 aa  278  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
386 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.58 
 
 
399 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.95 
 
 
401 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.86 
 
 
414 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.03 
 
 
405 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>