More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2862 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  77.16 
 
 
394 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  83.08 
 
 
399 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  78.17 
 
 
394 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  92.15 
 
 
395 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  78.17 
 
 
394 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  77.16 
 
 
394 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  84.05 
 
 
395 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  79.95 
 
 
394 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
395 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  77.92 
 
 
394 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  78.17 
 
 
394 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  77.92 
 
 
394 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  77.41 
 
 
394 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  77.92 
 
 
394 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  84.05 
 
 
395 aa  689    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 
394 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  77.92 
 
 
510 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  74.23 
 
 
397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  73.97 
 
 
397 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  68.19 
 
 
395 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  63.09 
 
 
397 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  60.91 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  54.64 
 
 
405 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  48.05 
 
 
398 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  47.53 
 
 
393 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  48.19 
 
 
426 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  47.57 
 
 
426 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  46.55 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  47.15 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
398 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.34 
 
 
399 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
402 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.07 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
399 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.62 
 
 
398 aa  324  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.08 
 
 
396 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
394 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.08 
 
 
385 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.08 
 
 
394 aa  310  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 
400 aa  309  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  45.09 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.55 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.46 
 
 
395 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.78 
 
 
406 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.78 
 
 
406 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  41.54 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.03 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.2 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.96 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  44.23 
 
 
406 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.23 
 
 
406 aa  300  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.51 
 
 
406 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.23 
 
 
406 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.23 
 
 
406 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  44.23 
 
 
406 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
395 aa  299  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.72 
 
 
396 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.15 
 
 
403 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
399 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.41 
 
 
400 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
417 aa  292  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1430  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.18 
 
 
408 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153186  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1871  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.45 
 
 
408 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2043  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.18 
 
 
408 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
401 aa  290  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.73 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1398  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.03 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.28 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.73 
 
 
414 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1415  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.9 
 
 
408 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.73 
 
 
446 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  46.2 
 
 
399 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.02 
 
 
406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.39 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.24 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.82 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.24 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.38 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.49 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.63 
 
 
406 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.65 
 
 
397 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.77 
 
 
399 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
397 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.25 
 
 
427 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.46 
 
 
399 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.95 
 
 
406 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.43 
 
 
404 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.42 
 
 
399 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.24 
 
 
400 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  39.5 
 
 
418 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.23 
 
 
396 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.95 
 
 
413 aa  279  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.9 
 
 
406 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.81 
 
 
402 aa  279  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>