More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2409 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  88.07 
 
 
394 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  77.97 
 
 
399 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  92.64 
 
 
394 aa  762    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  92.89 
 
 
394 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  92.89 
 
 
394 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  95.18 
 
 
394 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  89.09 
 
 
394 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  78.77 
 
 
395 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  93.15 
 
 
510 aa  738    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  92.89 
 
 
394 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  89.09 
 
 
394 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  95.69 
 
 
394 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
394 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  92.64 
 
 
394 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  95.43 
 
 
394 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  92.64 
 
 
394 aa  762    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  94.16 
 
 
394 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  99.75 
 
 
394 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  95.43 
 
 
394 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  92.64 
 
 
394 aa  762    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  78.77 
 
 
395 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  76.65 
 
 
395 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  77.16 
 
 
395 aa  614  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  71.28 
 
 
397 aa  567  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  71.54 
 
 
397 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  68.8 
 
 
395 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  59.38 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  60.82 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  52.07 
 
 
405 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  46.46 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  47.34 
 
 
398 aa  342  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  46.81 
 
 
398 aa  342  5e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  47.07 
 
 
398 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  45.93 
 
 
393 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  46.7 
 
 
426 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
394 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  46.44 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  45.91 
 
 
426 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  46.17 
 
 
426 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.03 
 
 
399 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 
385 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
385 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.04 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  45.65 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.64 
 
 
396 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  41.92 
 
 
395 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.74 
 
 
387 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.28 
 
 
395 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.81 
 
 
399 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
400 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.67 
 
 
387 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.96 
 
 
396 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
398 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 
399 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.81 
 
 
399 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.27 
 
 
395 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 
403 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.06 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  43.12 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.13 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  41.22 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.71 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.09 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0611  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.8 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.894863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.8 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0610  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.8 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0636462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.05 
 
 
404 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.66 
 
 
414 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.7 
 
 
405 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.55 
 
 
408 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.45 
 
 
405 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0645  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.8 
 
 
405 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.45 
 
 
405 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
399 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.66 
 
 
414 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.45 
 
 
405 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  42.78 
 
 
406 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.16 
 
 
405 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.06 
 
 
406 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.66 
 
 
446 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  42.78 
 
 
406 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.78 
 
 
406 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
406 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.67 
 
 
405 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.16 
 
 
405 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  42.74 
 
 
427 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.78 
 
 
406 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 
386 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  42.78 
 
 
406 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.21 
 
 
405 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>