More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1947 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  73.6 
 
 
443 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  74.88 
 
 
429 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  100 
 
 
433 aa  878    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  85.55 
 
 
431 aa  758    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  80.56 
 
 
431 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  63.9 
 
 
431 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  63.49 
 
 
430 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  63.51 
 
 
436 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  62.8 
 
 
436 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  54.83 
 
 
431 aa  444  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  48.6 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  40.59 
 
 
437 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.91 
 
 
448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.94 
 
 
428 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.15 
 
 
434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.52 
 
 
444 aa  240  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  36.91 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.41 
 
 
432 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.95 
 
 
436 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  36.02 
 
 
465 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.41 
 
 
452 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.52 
 
 
446 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  34.99 
 
 
427 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 
468 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  33.03 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  36.3 
 
 
441 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  35.31 
 
 
441 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  35.31 
 
 
442 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.95 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
454 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
454 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
461 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.43 
 
 
431 aa  222  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.71 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  32.48 
 
 
454 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  36.79 
 
 
441 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 
454 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 
450 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
421 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  35.42 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  35.43 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.93 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  35.93 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  35.93 
 
 
425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 
440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.93 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 
421 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.72 
 
 
401 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.27 
 
 
399 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  35.4 
 
 
443 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  37.1 
 
 
439 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  38.01 
 
 
390 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  34.45 
 
 
450 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  35.28 
 
 
425 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  33.5 
 
 
421 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  33.93 
 
 
421 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  34.16 
 
 
432 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.21 
 
 
441 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  31.68 
 
 
453 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  34.46 
 
 
419 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  34.06 
 
 
386 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  32.95 
 
 
432 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  33.49 
 
 
450 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  35.51 
 
 
438 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  33.56 
 
 
460 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
433 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  33.86 
 
 
464 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  34 
 
 
421 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  33.09 
 
 
471 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.05 
 
 
458 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 
421 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 
446 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  34.07 
 
 
375 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  33.25 
 
 
449 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  33.02 
 
 
449 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  33.25 
 
 
449 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  34.88 
 
 
394 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  33.64 
 
 
427 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  33.02 
 
 
450 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  34.56 
 
 
386 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.05 
 
 
401 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  33.1 
 
 
434 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  33.02 
 
 
450 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 
430 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 
432 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  34.54 
 
 
386 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  35.29 
 
 
418 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  34.11 
 
 
452 aa  202  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  33.02 
 
 
449 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  33.95 
 
 
437 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  33.18 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  33.02 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  33.58 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>