More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3669 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  79.29 
 
 		 429 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  100 
 
 		 443 aa  890    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  73.6 
 
 		 433 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  71.43 
 
 		 431 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  70.47 
 
 		 431 aa  624  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  63.85 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  59.05 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  60.05 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  59.57 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  55.5 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  51.51 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 		 437 aa  249  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.89 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  36.51 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.57 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.56 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.49 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.51 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.14 
 
 		 432 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.28 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.81 
 
 		 448 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  35.37 
 
 		 441 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  39.76 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.24 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.24 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.64 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.99 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.27 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.72 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.52 
 
 		 430 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  34.23 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  33.78 
 
 		 465 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 454 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.72 
 
 		 454 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  34.1 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.35 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.86 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.12 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 479 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  35.48 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.27 
 
 		 396 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  34.08 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  35.77 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  34.57 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.55 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.26 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  32.74 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  35.19 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.6 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  34.89 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.44 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  35.13 
 
 		 427 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 447 aa  202  9e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  34.95 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  34.84 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  35.44 
 
 		 398 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  32.95 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  35.68 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  35.46 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  36.76 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 		 459 aa  199  6e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  32.3 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2569  aminotransferase class-III  32.25 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.18 
 
 		 441 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  34.83 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  34.11 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  36.39 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  35.82 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  35.82 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  35.82 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  31.4 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  33.73 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  35.82 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  34.86 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  34.83 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  34.4 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  35.98 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  35.82 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  34.42 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  34.69 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  35.48 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  36.5 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  33.56 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  35.57 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>