More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3380 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  80.56 
 
 
433 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  74.83 
 
 
429 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  77.49 
 
 
431 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  100 
 
 
431 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  70.47 
 
 
443 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  64.02 
 
 
430 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  61.05 
 
 
431 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  63.57 
 
 
436 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  63.12 
 
 
436 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  54.59 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  51.17 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  40.19 
 
 
437 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  37.75 
 
 
465 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  37.8 
 
 
446 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.09 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.64 
 
 
432 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.88 
 
 
452 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  37.7 
 
 
441 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  40.05 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  36.56 
 
 
431 aa  239  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 
434 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  36.7 
 
 
441 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  36.44 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.27 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.65 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  37.7 
 
 
442 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.96 
 
 
394 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.43 
 
 
430 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
468 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  36.67 
 
 
446 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
478 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 
479 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  36 
 
 
446 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  36 
 
 
446 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  36 
 
 
446 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  37.62 
 
 
395 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  32.41 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  34.73 
 
 
427 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.81 
 
 
454 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.17 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  37.35 
 
 
390 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.2 
 
 
446 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  35.33 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  34.8 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  36.55 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.3 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  34.62 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  35.11 
 
 
446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.82 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  37.2 
 
 
386 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.14 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  35.94 
 
 
403 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  33.56 
 
 
432 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  36.19 
 
 
450 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  35.78 
 
 
375 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 
446 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  38.41 
 
 
431 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.2 
 
 
390 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  35.22 
 
 
400 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 
450 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  35.35 
 
 
440 aa  209  7e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  37.79 
 
 
402 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  37.79 
 
 
402 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  36.47 
 
 
386 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
401 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  32.57 
 
 
460 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  34.53 
 
 
421 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  35.05 
 
 
440 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.01 
 
 
458 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  36.02 
 
 
426 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  33.25 
 
 
419 aa  206  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 
430 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.98 
 
 
410 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  34.69 
 
 
390 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.42 
 
 
396 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  33.93 
 
 
421 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.63 
 
 
402 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.05 
 
 
441 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  34.3 
 
 
449 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 
425 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 
425 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  31.92 
 
 
448 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  35.78 
 
 
426 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  35.39 
 
 
442 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  35.03 
 
 
430 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  34.08 
 
 
449 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 
446 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>