More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1957 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  84.1 
 
 		 436 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  97.94 
 
 		 436 aa  783    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  100 
 
 		 436 aa  859    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  63.15 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  64.49 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  61.59 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  60.97 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  61.76 
 
 		 442 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  57.28 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  58.78 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  55.69 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  54.88 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  52.27 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  55.16 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  49.89 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  49.77 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  50.47 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  52.37 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  49.54 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  50.24 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  51.41 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  48.58 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  47.02 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  52.64 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  44.03 
 
 		 1023 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1015 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1015 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  44.52 
 
 		 1015 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  43.72 
 
 		 1049 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  47.73 
 
 		 978 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  43.56 
 
 		 1016 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1018 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  41.76 
 
 		 981 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  42 
 
 		 981 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  42 
 
 		 981 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  43.07 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  39.67 
 
 		 977 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  39.76 
 
 		 967 aa  279  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  41.18 
 
 		 994 aa  274  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  37.7 
 
 		 910 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  37.24 
 
 		 970 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  37.2 
 
 		 966 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  37.56 
 
 		 970 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  37.7 
 
 		 976 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  38.63 
 
 		 970 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  37.7 
 
 		 976 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  38.19 
 
 		 973 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  36.74 
 
 		 1003 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  38.17 
 
 		 973 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  38 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  37.65 
 
 		 975 aa  246  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  37.38 
 
 		 974 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  35.05 
 
 		 431 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.15 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  33.97 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  34.32 
 
 		 431 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  34.97 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.4 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  33.9 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  35.56 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  33.18 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  33.93 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  34.24 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  34.55 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.11 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  34.05 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  36.67 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  34.37 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  33.95 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  35.42 
 
 		 422 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.45 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  34.89 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  33.08 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.01 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  32.34 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.94 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.34 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.21 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  35.43 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.85 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  31.09 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  34.54 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.68 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  35.24 
 
 		 427 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  32.08 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  35.11 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.89 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  34.32 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  36.9 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  34.22 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.29 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  32.2 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  33.42 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.6 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.73 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  35 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>