More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0337 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  100 
 
 		 407 aa  843    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2591  aminotransferase class-III  67.78 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06750  ornithine aminotransferase  64.12 
 
 		 398 aa  527  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  50.52 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0425  aminotransferase class-III  45.32 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  48.87 
 
 		 403 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  45.14 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  46.63 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  34.51 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  36.86 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  36.21 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  37.22 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  33.76 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  35.85 
 
 		 441 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.14 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.73 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.62 
 
 		 393 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.76 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.48 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  34.38 
 
 		 432 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.83 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  32.56 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.55 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.93 
 
 		 441 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.64 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  35.11 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.87 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.25 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  35.03 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.59 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  35.4 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.75 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.05 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  38.56 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.28 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  33.57 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  34.73 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.48 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  35.6 
 
 		 414 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  33.33 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.85 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  34.97 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.16 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.66 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.01 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.87 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  33.94 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.09 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  33.87 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.42 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  34.2 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  35.66 
 
 		 419 aa  213  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  33.92 
 
 		 374 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  36.1 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.55 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  32.45 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.53 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  34.18 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  33.51 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  32.72 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  32.9 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.31 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.79 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.55 
 
 		 387 aa  210  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.07 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  34.11 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  31.73 
 
 		 386 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  34.27 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2733  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.12 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  35.81 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.33 
 
 		 429 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  34.16 
 
 		 459 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  34.16 
 
 		 468 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  34.16 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  35.96 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.43 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  31.46 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  32.67 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  33.96 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  34.65 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  33.96 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.91 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.9 
 
 		 472 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.2 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 458 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.91 
 
 		 459 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.91 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  34.79 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  34.03 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  33.07 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  32.75 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  32.75 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1628  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.88 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>