More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06750 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06750  ornithine aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  814    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2591  aminotransferase class-III  70.28 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  64.12 
 
 		 407 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  50.39 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  48.84 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0425  aminotransferase class-III  46.98 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  46.48 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  48.03 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  37.34 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  40.37 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.39 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  37.24 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  37.17 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  37.17 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  38.34 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.77 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.58 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  39.51 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  37.74 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  37.24 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.06 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  36.24 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.08 
 
 		 356 aa  236  7e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.25 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  35.53 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  35.79 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.99 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.69 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  35.33 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  35.98 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  35.42 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.4 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 397 aa  229  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  38.48 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.17 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.04 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  37.67 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  34.56 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.31 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  35 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.99 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  35.6 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  36.9 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  34.78 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 445 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.76 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.75 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  36.79 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.79 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.46 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.73 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  36.79 
 
 		 468 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  36.79 
 
 		 459 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  36.44 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.72 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  36.83 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.54 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.91 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.54 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.54 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.09 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.59 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.19 
 
 		 388 aa  221  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0152211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.38 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  34.48 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.63 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.96 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.27 
 
 		 477 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.65 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  32.54 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  37.26 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.71 
 
 		 459 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.71 
 
 		 459 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.71 
 
 		 459 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.55 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0169  N2-acetyl-L-lysine aminotransferase / acetylornithine aminotransferase  36.36 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000199062  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.71 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2733  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.12 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  33.74 
 
 		 475 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  33.99 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1054  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.77 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0163  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  35.26 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.75 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  32.93 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.32 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.25 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  36.83 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.76 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.24 
 
 		 437 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  33.07 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  33.6 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.39 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.22 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.59 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 		 444 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  33.95 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>