More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1633 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  100 
 
 		 360 aa  746    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  63.48 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  64.8 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  62.47 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0425  aminotransferase class-III  58.99 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  46.63 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2591  aminotransferase class-III  49.44 
 
 		 397 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06750  ornithine aminotransferase  48.03 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  39.61 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.19 
 
 		 395 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.52 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.13 
 
 		 395 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.86 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.07 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.49 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  36.59 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  36.31 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.22 
 
 		 428 aa  245  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  35.33 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  36.59 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.64 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.58 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.56 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  36.8 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  36.77 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  36.87 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  36.95 
 
 		 427 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.59 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.48 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  35.89 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  36.61 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  36.58 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.57 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  35.97 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  34.42 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.8 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.12 
 
 		 417 aa  235  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.71 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.53 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.64 
 
 		 429 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  35.62 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  34.71 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.26 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  36.17 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  36.05 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.36 
 
 		 429 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.16 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  35.62 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  37.36 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.36 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  34.44 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  34.99 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.54 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  37.36 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  37.85 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  37.36 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  35.71 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.64 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  35.42 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  33.51 
 
 		 390 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.36 
 
 		 459 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  37.67 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  33.79 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.99 
 
 		 472 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 414 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  36.46 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  36.46 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  35.26 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  33.79 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.33 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  35.92 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  35.92 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  33.51 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.07 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  36.14 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.06 
 
 		 459 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.06 
 
 		 459 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.06 
 
 		 459 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.98 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  35.16 
 
 		 391 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  36.31 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.07 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  36.19 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  36.54 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.62 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  33.06 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  35.14 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  35.81 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.78 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  35.47 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  34.71 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  34.51 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  32.7 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  34.69 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>