More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1580 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  78.35 
 
 		 411 aa  644    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  100 
 
 		 411 aa  823    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.19 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.19 
 
 		 459 aa  362  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.19 
 
 		 429 aa  362  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.19 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  45.95 
 
 		 429 aa  359  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  45.95 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  45.95 
 
 		 468 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.15 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.5 
 
 		 459 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.26 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.26 
 
 		 459 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.26 
 
 		 459 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.26 
 
 		 459 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  44.52 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  45.39 
 
 		 475 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  46.7 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  47.73 
 
 		 463 aa  346  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  44.96 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.59 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  44.89 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  43.56 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.44 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.32 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  46.59 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  43.95 
 
 		 475 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  45.97 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  46.12 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  42.51 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  39.85 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  41.8 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  41.8 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  44.66 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  39.29 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  39.29 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  39.11 
 
 		 396 aa  292  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  39.54 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  38.78 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  43.64 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  39.31 
 
 		 398 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  41.96 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  41.11 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  39.39 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  39.39 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  38.27 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  39.51 
 
 		 845 aa  285  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  39.86 
 
 		 955 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  39.45 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.7 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.43 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.99 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.85 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  38.32 
 
 		 402 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  39.35 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  35.65 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.24 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.54 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  38.63 
 
 		 458 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  36.21 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  40 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  41.32 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  43.2 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.76 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  38.82 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.08 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  42.32 
 
 		 391 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  38.58 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  43.24 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.89 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.37 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.33 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  42.44 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  40.51 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  41.99 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  39.74 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  41.36 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  39.73 
 
 		 396 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.71 
 
 		 416 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.63 
 
 		 397 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 		 396 aa  259  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  42.66 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  38.99 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.93 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  41.22 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  40.27 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  41.58 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.96 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>