More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0869 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  100 
 
 		 395 aa  817    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  64.1 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0425  aminotransferase class-III  61.08 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  63.48 
 
 		 360 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  59.85 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  50.52 
 
 		 407 aa  425  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2591  aminotransferase class-III  51.8 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06750  ornithine aminotransferase  50.39 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  39.49 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.43 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.08 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 395 aa  262  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.7 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39.04 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.3 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  37.59 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  39.68 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.05 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  37.44 
 
 		 431 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  37.84 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  37.24 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.9 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  39.08 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.5 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.68 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  37.72 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.74 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  39.41 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  36.78 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.11 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.32 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.11 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  38.99 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.3 
 
 		 386 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  36.93 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.34 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  37.57 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  37.57 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.57 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.57 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.57 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  37.57 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.57 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  37.84 
 
 		 415 aa  244  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  36.93 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.57 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 417 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.5 
 
 		 457 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  37.83 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  37.07 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  36.05 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.46 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.61 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  37.97 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.28 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  36.02 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.14 
 
 		 477 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.84 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  37.4 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  36.92 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  38.37 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.08 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.97 
 
 		 459 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.87 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  36.04 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  36.18 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.89 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  38.21 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  38.36 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.43 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  36.72 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.17 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.57 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  34.95 
 
 		 418 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  34.95 
 
 		 418 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 		 441 aa  235  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.17 
 
 		 459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.17 
 
 		 459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.17 
 
 		 459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  37.43 
 
 		 444 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  36.91 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.64 
 
 		 428 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  35.34 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.59 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.44 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  38.52 
 
 		 463 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.57 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  38.03 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.92 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  33.84 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  37 
 
 		 397 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>