More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1636 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  100 
 
 		 403 aa  837    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  67.33 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0869  aminotransferase class-III  64.1 
 
 		 395 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  64.8 
 
 		 360 aa  498  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0425  aminotransferase class-III  58.08 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0337  aminotransferase class-III  48.87 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06750  ornithine aminotransferase  48.84 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2591  aminotransferase class-III  50.13 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  38.44 
 
 		 408 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.68 
 
 		 429 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.32 
 
 		 429 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.27 
 
 		 429 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  40.27 
 
 		 468 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  40.27 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.27 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  40.27 
 
 		 459 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.27 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.01 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  41.02 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  41.22 
 
 		 411 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.94 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.9 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  37.72 
 
 		 431 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  40.94 
 
 		 477 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.3 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.51 
 
 		 477 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.63 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.63 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.63 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.63 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.62 
 
 		 459 aa  242  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.87 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.5 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.6 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  41.55 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  37.63 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.3 
 
 		 432 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.53 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  35.57 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  36.54 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.81 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.78 
 
 		 445 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.02 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.89 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  36.94 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.76 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  37.15 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  35.79 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.6 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  36.53 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.91 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  37.33 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  36.63 
 
 		 441 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  37.92 
 
 		 444 aa  225  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  36.39 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  38.64 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  35.52 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  38.31 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  35.64 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.67 
 
 		 436 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.96 
 
 		 387 aa  223  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.79 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  34.74 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.94 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  37.84 
 
 		 475 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  36.65 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  35.71 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  38.1 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  37.02 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.19 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.24 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  37.56 
 
 		 460 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  35.81 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  35.81 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  35.23 
 
 		 419 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  35.84 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.09 
 
 		 436 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.81 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  34.93 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.1 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  36.67 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  35.06 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.77 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.15 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  34.32 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  34.24 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.86 
 
 		 458 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  34.94 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.43 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  34.66 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  35.84 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  35.84 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  35.84 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  35.84 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  35.84 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>