More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0169 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0169  N2-acetyl-L-lysine aminotransferase / acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
386 aa  783    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000199062  normal  0.127508 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  69.17 
 
 
388 aa  564  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0152211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1923  aminotransferase class-III  51.09 
 
 
381 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.779903  normal  0.0552026 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0283  aminotransferase  48.8 
 
 
392 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  48.56 
 
 
383 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1167  aminotransferase class-III  50.54 
 
 
381 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000969494 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0767  aminotransferase class-III  48.26 
 
 
380 aa  368  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000633967  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  44.86 
 
 
415 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
391 aa  315  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.86 
 
 
395 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.7 
 
 
393 aa  300  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.89 
 
 
393 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0221  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.28 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  38.67 
 
 
376 aa  285  8e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
390 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  39.73 
 
 
386 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  38.07 
 
 
375 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.98 
 
 
385 aa  276  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  37.4 
 
 
393 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
385 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  38.62 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.77 
 
 
375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.2 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.22 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  39.25 
 
 
393 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.99 
 
 
387 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 
393 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.87 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
395 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  41.29 
 
 
382 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  36.46 
 
 
402 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.84 
 
 
396 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 
380 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  39.1 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.56 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  37.93 
 
 
386 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  37.23 
 
 
386 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
385 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.96 
 
 
388 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.05 
 
 
417 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  39.1 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  37.87 
 
 
395 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  38.44 
 
 
384 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  37.14 
 
 
386 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  37.87 
 
 
395 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3786  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.56 
 
 
411 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742991  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 
386 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.94 
 
 
374 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 
386 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.48 
 
 
383 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3641  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.13 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  38.2 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4669  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.32 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160127  normal  0.232002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.89 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  37.93 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.7 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  36.15 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  37.53 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03210  bifunctional acetylornithine aminotransferase/ succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.06 
 
 
406 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0353  succinylornithine transaminase family  36.06 
 
 
406 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.124803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03162  hypothetical protein  36.06 
 
 
406 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0353  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.06 
 
 
406 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3665  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.87 
 
 
405 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.873373  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  35.49 
 
 
388 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0450  aminotransferase class-III  37.84 
 
 
371 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.778818  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.11 
 
 
387 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3773  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.87 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3739  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.77 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0111513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3665  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.87 
 
 
405 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.451233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  37.93 
 
 
386 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  37.93 
 
 
386 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  36.97 
 
 
404 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3829  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.06 
 
 
406 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.17 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  36.01 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.97 
 
 
405 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3836  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.07 
 
 
405 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.98 
 
 
394 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  37.93 
 
 
386 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4554  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.5 
 
 
404 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  37.27 
 
 
394 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  37.37 
 
 
395 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  37.86 
 
 
406 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 
391 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.2 
 
 
396 aa  250  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  37.86 
 
 
406 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.64 
 
 
397 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.71 
 
 
395 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.17 
 
 
399 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.41 
 
 
403 aa  249  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.11 
 
 
413 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.6 
 
 
406 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36 
 
 
411 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.34 
 
 
406 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.89 
 
 
399 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.6 
 
 
406 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.6 
 
 
406 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  37.34 
 
 
406 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>