More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0283 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0283  aminotransferase  100 
 
 
392 aa  791    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1167  aminotransferase class-III  88.71 
 
 
381 aa  679    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000969494 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1923  aminotransferase class-III  88.19 
 
 
381 aa  674    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.779903  normal  0.0552026 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1404  aminotransferase class-III  88.48 
 
 
383 aa  684    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.443564  normal  0.505281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0767  aminotransferase class-III  64.38 
 
 
380 aa  526  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000633967  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0169  N2-acetyl-L-lysine aminotransferase / acetylornithine aminotransferase  48.8 
 
 
386 aa  375  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000199062  normal  0.127508 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.08 
 
 
388 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0152211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
389 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.91 
 
 
393 aa  292  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
391 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 
415 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.27 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  41.78 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.94 
 
 
395 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.35 
 
 
388 aa  278  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
375 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0221  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.73 
 
 
392 aa  273  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.46 
 
 
395 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
387 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  40.64 
 
 
380 aa  265  7e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  38.34 
 
 
390 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.93 
 
 
385 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.47 
 
 
396 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 
386 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  37.74 
 
 
375 aa  258  9e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  38.95 
 
 
385 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
399 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.58 
 
 
399 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
402 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  37.3 
 
 
426 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  38.9 
 
 
396 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.89 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  39.25 
 
 
384 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  36.39 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  37.17 
 
 
398 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  37.2 
 
 
386 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  36.39 
 
 
386 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.63 
 
 
399 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 
394 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 
394 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  37.99 
 
 
396 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.56 
 
 
398 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01150  acetylornithine aminotransferase, ornithine transaminase (Eurofung)  38.04 
 
 
476 aa  249  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.202493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 
398 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
386 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
386 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  35.94 
 
 
397 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.98 
 
 
399 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  34.82 
 
 
393 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.66 
 
 
399 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  37.34 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.71 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.73 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  34.54 
 
 
393 aa  245  9e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  35.92 
 
 
386 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  37.17 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  35.68 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.7 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3786  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.42 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742991  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  39.32 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  34.55 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  37.79 
 
 
399 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.94 
 
 
452 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  34.21 
 
 
376 aa  243  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  35.77 
 
 
375 aa  242  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3665  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.96 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.873373  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  36.65 
 
 
386 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  39.07 
 
 
382 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.87 
 
 
406 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.75 
 
 
387 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3665  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.96 
 
 
405 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.451233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3641  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.34 
 
 
407 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  34.5 
 
 
427 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3836  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.96 
 
 
405 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3773  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.7 
 
 
405 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  36.79 
 
 
391 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3739  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.96 
 
 
405 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0111513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03210  bifunctional acetylornithine aminotransferase/ succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.34 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0353  succinylornithine transaminase family  39.34 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.124803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.8 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  36.39 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  35.6 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4669  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.34 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160127  normal  0.232002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03162  hypothetical protein  39.34 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.34 
 
 
408 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0353  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.34 
 
 
406 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  37.01 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 
396 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.44 
 
 
427 aa  239  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.55 
 
 
396 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3829  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.07 
 
 
406 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.42 
 
 
374 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  34.79 
 
 
394 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.11 
 
 
375 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  37.37 
 
 
396 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  33.69 
 
 
403 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  34.79 
 
 
394 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.14 
 
 
388 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>