More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2551 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2551  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  63.03 
 
 
284 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.750805  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1502  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.94 
 
 
269 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.62 
 
 
266 aa  244  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.02 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  45.75 
 
 
254 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0097  serine protease  47.35 
 
 
295 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.72 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1602  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1208  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.02 
 
 
260 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.47 
 
 
464 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  29.01 
 
 
471 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  33.64 
 
 
476 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  33.8 
 
 
485 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  30.17 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.22 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  29.82 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  33.49 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.22 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  32.71 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  31.71 
 
 
477 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  32.81 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  32.81 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  32.5 
 
 
487 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  29.72 
 
 
518 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  34.58 
 
 
535 aa  82.8  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  31.43 
 
 
491 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  32.81 
 
 
490 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  28.31 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  26.71 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  32.46 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.26 
 
 
507 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29.89 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  29.17 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  32.63 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.46 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  30.05 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  29.03 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  30.23 
 
 
516 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  30.62 
 
 
464 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  29.54 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  29.25 
 
 
473 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  29.78 
 
 
498 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 
506 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  33.62 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  31.46 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  30.29 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  30.29 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  30.29 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  30.77 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  28.77 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  30.14 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  30.09 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  31.94 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  30.7 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.95 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  30.29 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 
386 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.24 
 
 
484 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  34.26 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.24 
 
 
481 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  30.37 
 
 
508 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1346  protease Do  28.57 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.62004  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1646  serine protease, DO/DeqQ family  28.57 
 
 
494 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  31.1 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  29 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  30.14 
 
 
505 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  29.52 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  29.11 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  31.03 
 
 
503 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  27.78 
 
 
500 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  29.81 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  28.1 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  29.52 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  30.5 
 
 
520 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  29.95 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  27.27 
 
 
499 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  29.24 
 
 
481 aa  76.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  31.58 
 
 
489 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.17 
 
 
545 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  30.43 
 
 
503 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  29.25 
 
 
481 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 
477 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 
477 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  28.68 
 
 
487 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  28.77 
 
 
467 aa  75.5  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  31.46 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.31 
 
 
480 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  28.77 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  29.41 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  29.52 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  26.67 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  30.62 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  29.17 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.29 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  30.62 
 
 
491 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  31.51 
 
 
511 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  30.05 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>