More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2442 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.71 
 
 
266 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.43 
 
 
261 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1602  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.51 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.68 
 
 
261 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  46.25 
 
 
254 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.64 
 
 
284 aa  214  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.750805  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0097  serine protease  44.77 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1502  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.88 
 
 
269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2551  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.72 
 
 
281 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1208  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.21 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  27.08 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  28.22 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 
752 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.38 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
395 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.41 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.5 
 
 
584 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33 
 
 
541 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1641  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  32.63 
 
 
518 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1819  hypothetical protein  32.63 
 
 
518 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1664  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  32.63 
 
 
518 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.442424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  31.96 
 
 
503 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  30.1 
 
 
477 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1430  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  32.63 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.94162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0449  MucD  32.63 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  29.59 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  29.59 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  30.29 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  29.59 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.53 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.53 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.53 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  30.29 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  30.29 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  30.29 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.54 
 
 
488 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  26.69 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  27.19 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.19 
 
 
507 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  29.23 
 
 
482 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  30.29 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  28.71 
 
 
474 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  30.29 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  26.04 
 
 
464 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  30.41 
 
 
500 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  28.71 
 
 
474 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  30.93 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  26.41 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1379  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0754  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.74 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.88 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  32.02 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.34 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  30.37 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  29.33 
 
 
494 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  29.39 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.8 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  26.92 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  28.81 
 
 
583 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  31.96 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.33 
 
 
483 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  31.58 
 
 
502 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  28.27 
 
 
487 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  29.86 
 
 
348 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  33.16 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.31 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 
545 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  28.93 
 
 
594 aa  66.2  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  30 
 
 
495 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.92 
 
 
484 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.92 
 
 
481 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.64 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.74 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  30.93 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  31.41 
 
 
473 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.11 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  28.06 
 
 
478 aa  65.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  26.5 
 
 
511 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.03 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  29.39 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  27.34 
 
 
444 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  30.77 
 
 
471 aa  65.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  32.64 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  30 
 
 
495 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  30.05 
 
 
483 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  30 
 
 
495 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  30 
 
 
495 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  30.37 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  24.91 
 
 
473 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  30 
 
 
495 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  30.05 
 
 
483 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  30.05 
 
 
483 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  29.02 
 
 
514 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  30.73 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  30.73 
 
 
473 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.73 
 
 
458 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  28.86 
 
 
496 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>