More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1208 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1208  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  50.81 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.17 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.94 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1602  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.67 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.39 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.89 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.750805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2551  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.43 
 
 		 281 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1502  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.77 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0097  serine protease  39.34 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.69 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  28.79 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.32 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.76 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  30.21 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.32 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.31 
 
 		 368 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  29.96 
 
 		 527 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.77 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  27.87 
 
 		 584 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  31.6 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.77 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.77 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  28.28 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.36 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.43 
 
 		 674 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  28.1 
 
 		 528 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  27.54 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.09 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.43 
 
 		 552 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.86 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  28.78 
 
 		 483 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.84 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  28.95 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.85 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  28.78 
 
 		 483 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.76 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  29.86 
 
 		 354 aa  62  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  28.1 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.46 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.32 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  29.74 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  27.66 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  29.35 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  27.66 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  29.73 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  30.41 
 
 		 511 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  31.28 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  29.8 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.26 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  30.39 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  28.8 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  30.05 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.8 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  26.27 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  27.9 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  28.16 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  26.73 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  27.12 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.27 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  28.36 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  25.2 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  25.2 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  28.27 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0611  serine protease, putative  26.6 
 
 		 585 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.413309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  28.27 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  27.09 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.73 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  28.27 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.51 
 
 		 509 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  28.72 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  29.35 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.96 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  27.59 
 
 		 506 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  27.63 
 
 		 423 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.33 
 
 		 475 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  29.9 
 
 		 472 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.33 
 
 		 475 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.94 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.33 
 
 		 475 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.94 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  29.74 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2263  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164031  normal  0.0202941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.04 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  28.5 
 
 		 425 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  31.75 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  29.29 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  30.26 
 
 		 473 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  30.21 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  30.21 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  27.89 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.55 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  23.21 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  27.67 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  30.21 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  27.8 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>