More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0611 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0611  serine protease, putative  100 
 
 		 585 aa  1184    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.413309  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1103  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  60.41 
 
 		 774 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00762901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1081  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.41 
 
 		 774 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.394549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5314  serine protease  41.95 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5710  serine protease  41.95 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5351  serine protease  41.95 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000264065  hitchhiker  6.04762e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5584  serine protease  41.95 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5645  serine protease  41.61 
 
 		 391 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0281098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5610  serine protease  41.61 
 
 		 381 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5158  serine protease  41.61 
 
 		 391 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5567  serine protease  41.61 
 
 		 391 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7078e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5254  2-alkenal reductase  40.94 
 
 		 395 aa  213  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5142  serine protease  41.33 
 
 		 391 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  42.4 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4001  2-alkenal reductase  39.4 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  41.45 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  41.45 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  37.57 
 
 		 413 aa  207  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  41.09 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  41.09 
 
 		 413 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  41.09 
 
 		 413 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  40.73 
 
 		 413 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  37.28 
 
 		 413 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  37.57 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  41.09 
 
 		 413 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  37.85 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  40.21 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.06 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  38.73 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  39.1 
 
 		 379 aa  189  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  32.11 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  32.11 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2002  trypsin-like serine protease  37.32 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.172847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  38.89 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  32.84 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  36.9 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  31.25 
 
 		 409 aa  172  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  38.44 
 
 		 425 aa  166  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.01 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  34.97 
 
 		 513 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  30.12 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  36.93 
 
 		 502 aa  157  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  31.37 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  32.98 
 
 		 409 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.9 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  34.58 
 
 		 502 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  34.15 
 
 		 506 aa  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  35.4 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  34.03 
 
 		 395 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  35.74 
 
 		 498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.05 
 
 		 521 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.67 
 
 		 640 aa  146  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  31.71 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  31.97 
 
 		 597 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  33.24 
 
 		 459 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  31.69 
 
 		 504 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  27.53 
 
 		 396 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  32.1 
 
 		 385 aa  143  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  31.12 
 
 		 476 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1346  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.21 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  34.19 
 
 		 393 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  34.04 
 
 		 408 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  33.79 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.93 
 
 		 394 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  27.5 
 
 		 511 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  33.68 
 
 		 408 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.54 
 
 		 396 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  33.1 
 
 		 594 aa  140  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  30.79 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  31.29 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  31.13 
 
 		 673 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.87 
 
 		 367 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.38 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  36.22 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  33.77 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  32.18 
 
 		 412 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.98 
 
 		 512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  33.56 
 
 		 397 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  29.06 
 
 		 472 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.92 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  30.82 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  30.82 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  30.82 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  30.82 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.64 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  30.82 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  30.82 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  30.82 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  30.82 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  32.19 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  30.79 
 
 		 350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  32.19 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  31.08 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.46 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.28 
 
 		 459 aa  135  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  32.87 
 
 		 476 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>