More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0097 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0097  serine protease  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.59 
 
 		 266 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4394  serine protease  45.75 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.79 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.77 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.56 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.750805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2551  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1602  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.47 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.63 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1502  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.7 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1208  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.69 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  31.98 
 
 		 492 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  31.98 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  31.98 
 
 		 479 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  26.34 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.71 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  30.96 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  26.83 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  26.83 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  26.83 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.3 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.51 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.15 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  26.34 
 
 		 494 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.95 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  28.28 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  26.34 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1664  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  27.94 
 
 		 518 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.442424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  26.34 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1641  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  27.94 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1819  hypothetical protein  27.94 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.3 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  27 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  26.24 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  26.56 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.63 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  27.78 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  28.43 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  26.04 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1430  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  31.51 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.94162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0449  MucD  31.51 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  27.4 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  27.23 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  27.86 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.35 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.35 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  27.51 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  29.74 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.35 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  26.16 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  27 
 
 		 489 aa  62.4  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  27.36 
 
 		 511 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1154  2-alkenal reductase  29.29 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  25.52 
 
 		 503 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  29.56 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  27.09 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  25.52 
 
 		 504 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  27.04 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  25.96 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  25.96 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.55 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  27.14 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.7 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  25.53 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  25.96 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  25.96 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  25.96 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  25.96 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  27.14 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  29.56 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  25.96 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  28.02 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  29.13 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.28 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  25.18 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  26.77 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  28.21 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.93 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  26.73 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  26.96 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  27.14 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  27.23 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  28.64 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  26.24 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  25.56 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  25.56 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  26.76 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  27.52 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  28.06 
 
 		 481 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.63 
 
 		 458 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  32.9 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  27.82 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.88 
 
 		 614 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  27.55 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  25.56 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  26.67 
 
 		 524 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.63 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  27.86 
 
 		 477 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>