More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11305 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11305  dehydrogenase FAD flavoprotein GMC oxidoreductase  100 
 
 		 528 aa  1072    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1091  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.89 
 
 		 518 aa  499  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.514373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7146  Choline dehydrogenase  50.67 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1731  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.91 
 
 		 530 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.77 
 
 		 529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.96 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.81 
 
 		 541 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.17 
 
 		 530 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.09 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.94 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.19 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.67 
 
 		 563 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  44.71 
 
 		 531 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.53 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.8 
 
 		 531 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.3 
 
 		 535 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.92 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.78 
 
 		 546 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.71 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.54 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.12 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  43.15 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  42.28 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.56 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  39.81 
 
 		 574 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.37 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 		 576 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.94 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.51 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.57 
 
 		 534 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.02 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.43 
 
 		 576 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.49 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.25 
 
 		 542 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.12 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  45.04 
 
 		 531 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  42.44 
 
 		 559 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.23 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.01 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.14 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.07 
 
 		 534 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  41.04 
 
 		 562 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.62 
 
 		 552 aa  364  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  41.92 
 
 		 562 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.72 
 
 		 534 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  43.07 
 
 		 574 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 548 aa  362  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  41.68 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.74 
 
 		 543 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.77 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.02 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3115  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.02 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  38.65 
 
 		 572 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.2 
 
 		 546 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.76 
 
 		 518 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.39 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.58 
 
 		 1290 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.5 
 
 		 538 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  41.82 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  41.82 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  41.82 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.96 
 
 		 530 aa  354  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  37.31 
 
 		 562 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.86 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  40.62 
 
 		 570 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.2 
 
 		 561 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2148  GMC family oxidoreductase  42.51 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.34 
 
 		 537 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  38.49 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  38.27 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  38.27 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  40.79 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.31 
 
 		 536 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  38.27 
 
 		 561 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  40.62 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  38.27 
 
 		 561 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.07 
 
 		 541 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2941  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 547 aa  349  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3275  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 547 aa  349  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.183424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0411  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 547 aa  349  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3406  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 547 aa  349  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0228  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 547 aa  349  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3089  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.49 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.55 
 
 		 552 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0216  GMC family oxidoreductase  42.75 
 
 		 547 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0487725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.04 
 
 		 572 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  38.39 
 
 		 560 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  41.08 
 
 		 549 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  41.08 
 
 		 549 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  42.02 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  41.08 
 
 		 549 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.67 
 
 		 546 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101134  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  41.08 
 
 		 549 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3070  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.67 
 
 		 546 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.606173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  37.8 
 
 		 556 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3601  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.01 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>