89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0027 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  77.67 
 
 		 437 aa  718    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  929    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  47.89 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  46.01 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  44.86 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  44.3 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  46.31 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  42.83 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  44.01 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  41.42 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  37.88 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  36.59 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  32.35 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  34.44 
 
 		 455 aa  239  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  32.5 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  34.51 
 
 		 434 aa  235  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  34.98 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  34.29 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  33.41 
 
 		 440 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  34.16 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  33.41 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  33.41 
 
 		 437 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.05 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  31.41 
 
 		 456 aa  212  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  33.11 
 
 		 437 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  32.16 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  32.92 
 
 		 456 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  32.61 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  43.33 
 
 		 210 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  32.35 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  30.64 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  27.47 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  28.41 
 
 		 431 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  26.81 
 
 		 463 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  27.17 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.13 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.42 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.8 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  23.95 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.26 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  23.24 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.55 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.39 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.4 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.53 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  23.13 
 
 		 360 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.56 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  22.7 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.12 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  27.93 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  21.33 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  25.3 
 
 		 339 aa  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  22.81 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  30.4 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  34.65 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.34 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  22.28 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  21.34 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  27.62 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.41 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  27.27 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  22.17 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  27.27 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.62 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  38.37 
 
 		 115 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  22.49 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  28.3 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  22.33 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  24.47 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  22.33 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  22.08 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  28.72 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  23.06 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  22.29 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  26.2 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.59 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.29 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.75 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  22.16 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  27.47 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  23.21 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.03 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.87 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  22.83 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  30.43 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.42 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.62 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  22.87 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  25.54 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>