190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3078 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  770    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  49.87 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  43.12 
 
 		 378 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  42.74 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  40.71 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  31.7 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  31.7 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  27.69 
 
 		 417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  31.2 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.27 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  29.94 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.03 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  29.49 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  27.09 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  27.53 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  29.26 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  27.16 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  27.98 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  26.93 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  26.82 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.94 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  27.37 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  26.43 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.61 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  28.88 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  27.98 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  26.77 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  26.42 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25.85 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  25.55 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  25.34 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.34 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  27.24 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  28.69 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  25.56 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.07 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  25.21 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  28.27 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  27.87 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  26.06 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.15 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  25.56 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  25.45 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.88 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.32 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  26.18 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.51 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  24.23 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  27.99 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  24.59 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  25.14 
 
 		 454 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.93 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  23.64 
 
 		 418 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  26.06 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  24.86 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  25.8 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  27.96 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  27.27 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  26.72 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  24.7 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  27.96 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  28.05 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  26.26 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  24.59 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.76 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.48 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  26.41 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.1 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  26.37 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  26.55 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  24.52 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.95 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  25.28 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  26.76 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  25 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.45 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  24.12 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  26.33 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  25.29 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  24.12 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  27.04 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.57 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  23.35 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.45 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  25.71 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.84 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  25.45 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.07 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  25.95 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  25.31 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  26.11 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  27.35 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  27.51 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  23.45 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  25.74 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  25.21 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>