149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2354 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 		 506 aa  1027    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  40.12 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  39.61 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  36.33 
 
 		 485 aa  326  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  28.77 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  27.66 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  27.48 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  28.07 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  26.18 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  21.58 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  27.82 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.32 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.44 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  27.93 
 
 		 417 aa  94.7  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  28.13 
 
 		 429 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.32 
 
 		 393 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  23.47 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  27.84 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.68 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  25.08 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.6 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.6 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  24.11 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  24.27 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  25.07 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  31.94 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  31.94 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  28.25 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.09 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.91 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  23.95 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.07 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.39 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  24.76 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  24.76 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.32 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  22.49 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  25.95 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  26.44 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  24.92 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.47 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  26.55 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  25.74 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  26.34 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  25.9 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.65 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  26.71 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  25.08 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.31 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  30.07 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  25.39 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  28.19 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  29.95 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  23.65 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.72 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  25.32 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  22.13 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  21.6 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  27.02 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  26.33 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  20.35 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  26.54 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  28.41 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  22.77 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  26.21 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  27.01 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  23.89 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  26.55 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.52 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  25.08 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.68 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  24.47 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.44 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  26.15 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25.42 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  26.16 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  24.71 
 
 		 399 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  30.22 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  32.29 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  25.48 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  23.3 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  23.64 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  31.49 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  31.49 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  30.51 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  24 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  29.17 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  26.43 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  24.61 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  25.79 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  20.6 
 
 		 427 aa  57  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  20.55 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  24.93 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.39 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  20.38 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.8 
 
 		 425 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>