175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0540 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  89.9 
 
 
406 aa  744    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  815    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  82.51 
 
 
406 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  59.46 
 
 
407 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  53.09 
 
 
412 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  52.59 
 
 
412 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  53.92 
 
 
417 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  46.12 
 
 
412 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  46.08 
 
 
418 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  45.81 
 
 
415 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  47.06 
 
 
415 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  44.12 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  40.1 
 
 
416 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  43.07 
 
 
411 aa  289  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  42.31 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  37.86 
 
 
454 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  38.16 
 
 
415 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  37.8 
 
 
436 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  33.33 
 
 
426 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  34.83 
 
 
425 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  32.27 
 
 
418 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  32.33 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  33.33 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  32.08 
 
 
474 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  33.98 
 
 
386 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.43 
 
 
391 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  32.04 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  34.05 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  32.18 
 
 
392 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.88 
 
 
421 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  34.23 
 
 
407 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  32.97 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  32.26 
 
 
409 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.77 
 
 
386 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  29.79 
 
 
392 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  34.5 
 
 
385 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  32.99 
 
 
389 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.25 
 
 
409 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.09 
 
 
394 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  32.04 
 
 
388 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.18 
 
 
385 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  28.26 
 
 
408 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  29.91 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  29.43 
 
 
412 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  31.22 
 
 
413 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  29.88 
 
 
390 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  39.45 
 
 
269 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  30.17 
 
 
394 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  28.34 
 
 
388 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  31.23 
 
 
384 aa  149  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  27.98 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30.23 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  32.98 
 
 
389 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  30.52 
 
 
380 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  30.39 
 
 
388 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  30.02 
 
 
387 aa  143  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  30.35 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  32.73 
 
 
389 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.04 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  28.47 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  27.74 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  29.87 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  27.3 
 
 
390 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  29.18 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  29.64 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  29.57 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  28.16 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  29.09 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  29.09 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.71 
 
 
259 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  29.82 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.67 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  28.79 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.03 
 
 
425 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.03 
 
 
378 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  27.22 
 
 
376 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.34 
 
 
376 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.93 
 
 
378 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.09 
 
 
402 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.88 
 
 
379 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  28.67 
 
 
426 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  25.54 
 
 
416 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  27.73 
 
 
394 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.17 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  26.93 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.97 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  25.97 
 
 
419 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.09 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.09 
 
 
382 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  26.47 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  30.77 
 
 
229 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.54 
 
 
380 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  28.12 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  26.52 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  28.73 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  23.48 
 
 
396 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.15 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  26.29 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  26.87 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>