119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4874 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  100 
 
 
399 aa  820    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  36.25 
 
 
398 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  35.66 
 
 
406 aa  256  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  34.65 
 
 
418 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  29.09 
 
 
445 aa  164  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  30.26 
 
 
396 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  29.83 
 
 
441 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  29.74 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  28.37 
 
 
437 aa  156  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  32.58 
 
 
423 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  31.43 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  27.8 
 
 
431 aa  145  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  31.47 
 
 
423 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  31.82 
 
 
423 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  32 
 
 
421 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  31.57 
 
 
423 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  28.35 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  28.13 
 
 
428 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  28.73 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.43 
 
 
414 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  30.62 
 
 
428 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  30.32 
 
 
427 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  30.58 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  26.7 
 
 
466 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  29.62 
 
 
471 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  29.47 
 
 
426 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  28.34 
 
 
425 aa  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  29.59 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  27.6 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  30.81 
 
 
403 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  28.42 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  29.94 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  28.95 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  28.95 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
413 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  28.72 
 
 
432 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  33.58 
 
 
430 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  28.4 
 
 
415 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  27.48 
 
 
427 aa  116  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  28.26 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  28.37 
 
 
424 aa  116  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  26.52 
 
 
410 aa  112  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  25.14 
 
 
542 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.73 
 
 
435 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  30.64 
 
 
413 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  28.53 
 
 
400 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.58 
 
 
388 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  31.43 
 
 
413 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  35.66 
 
 
159 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  28.09 
 
 
477 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  25.97 
 
 
434 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  29.17 
 
 
410 aa  94  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  27.55 
 
 
417 aa  92.8  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.38 
 
 
477 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  34.64 
 
 
196 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.74 
 
 
476 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.6 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.59 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.08 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.32 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.32 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  27.14 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.83 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.48 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.33 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.1 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.47 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  23.1 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.3 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.83 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.83 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  20.12 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  22.68 
 
 
382 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  22.68 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  24.25 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  23.82 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  21.99 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  24.19 
 
 
501 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  24.83 
 
 
458 aa  60.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  24.09 
 
 
465 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.04 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  21.21 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  22.4 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  24.92 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  24.92 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  22.85 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  23.79 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.97 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  22.78 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  24.76 
 
 
436 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.97 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  26.25 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  22.43 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  28.99 
 
 
543 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  20.29 
 
 
413 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  24.1 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  21.56 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.12 
 
 
385 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  21.45 
 
 
425 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  21.76 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>