157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0904 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  79.11 
 
 		 427 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  83.8 
 
 		 428 aa  756    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  100 
 
 		 428 aa  875    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  48.03 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  37.18 
 
 		 427 aa  293  5e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  36.74 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  36.83 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  35.12 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  35.28 
 
 		 423 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  34.88 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  34.33 
 
 		 466 aa  259  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  37.47 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  37.47 
 
 		 420 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  35.55 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  36.71 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  34.93 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  36.04 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  33.56 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  35.8 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  34.89 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  34.89 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  35.06 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  34.69 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  32.37 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  31.91 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  31.93 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  32.23 
 
 		 430 aa  194  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  32.73 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  31.29 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  29.25 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  32.78 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  28.4 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  28.87 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  30.57 
 
 		 542 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  31.39 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  31.22 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  30.82 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  28.87 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  27.05 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  30.62 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  29.32 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  29.23 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.25 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  28.61 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  27.76 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  28.77 
 
 		 360 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  38.1 
 
 		 196 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  27.47 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  27.37 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  27.03 
 
 		 393 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.65 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  27.6 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  28.91 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  26.98 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.78 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.11 
 
 		 487 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.7 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  28.53 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.17 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  28.01 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  23.95 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  25.06 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  24.88 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  26.35 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.37 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.27 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.02 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  23.65 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.51 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.6 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.29 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  25.76 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  24.11 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  24.07 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.35 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  24.79 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  27.64 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.28 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.02 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  23.44 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  25.58 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.87 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.16 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  21.5 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.6 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  22.47 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  28.74 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  28.74 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  31.88 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  31.88 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  22.9 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  23.44 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  22.17 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  23.38 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  20.05 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  21.96 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  23.99 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  28.72 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  22.78 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>