160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1853 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1853  ATPase  100 
 
 
427 aa  858    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  34.89 
 
 
462 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  30.56 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  30.77 
 
 
432 aa  180  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  30.81 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  31.45 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  31.59 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  31.59 
 
 
424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  30.77 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  29.6 
 
 
431 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  32.08 
 
 
431 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  32.84 
 
 
427 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  31.79 
 
 
388 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  28.5 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  28.5 
 
 
426 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  25.35 
 
 
466 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  30.29 
 
 
430 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  30.52 
 
 
427 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  28.93 
 
 
428 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  30.19 
 
 
423 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  29.32 
 
 
428 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  27.97 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  28.85 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  28.85 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  32.68 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.65 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  27.94 
 
 
437 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  27.87 
 
 
423 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  28.81 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  33.15 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  28.29 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  29.07 
 
 
410 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  30.9 
 
 
403 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  27.56 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  27.46 
 
 
418 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  28.42 
 
 
425 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  23.24 
 
 
417 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  26.53 
 
 
542 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  27.81 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25.31 
 
 
410 aa  117  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  27.48 
 
 
399 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  33.84 
 
 
196 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  24.94 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  25.32 
 
 
413 aa  110  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.94 
 
 
393 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.81 
 
 
400 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  26.39 
 
 
398 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  24.16 
 
 
413 aa  103  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.18 
 
 
477 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.91 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.15 
 
 
476 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  26.49 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  27.14 
 
 
477 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.76 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  26.18 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.08 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.26 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  25.53 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.26 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  25.51 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.18 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.45 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.88 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  21.49 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.65 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  23.15 
 
 
382 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  22.35 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.25 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  23.81 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.51 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  22.31 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.57 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  22.64 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  23.81 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.74 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  21.51 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.03 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  21.21 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  21.93 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  21.99 
 
 
415 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.38 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  21.89 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  21.23 
 
 
487 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.77 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  20.05 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  22.22 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  23.33 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  23.3 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  23.33 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  21.97 
 
 
378 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  19.73 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  20.94 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  20.2 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  25.37 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.55 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  22.3 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  20.27 
 
 
413 aa  61.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  26.78 
 
 
458 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>