189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0493 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  875    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  39.21 
 
 
427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  40.25 
 
 
413 aa  252  7e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  40.3 
 
 
413 aa  248  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  36.34 
 
 
423 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  35.34 
 
 
423 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  34.92 
 
 
423 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  35.53 
 
 
423 aa  219  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  35.82 
 
 
417 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  34.38 
 
 
430 aa  206  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  33.41 
 
 
427 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  34.88 
 
 
431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  34.38 
 
 
410 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  33.41 
 
 
415 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  32.78 
 
 
466 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  32.23 
 
 
428 aa  194  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  30.54 
 
 
427 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  32.86 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  32.71 
 
 
403 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  30.71 
 
 
428 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  33.84 
 
 
417 aa  176  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  29.22 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  29.22 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  30.87 
 
 
429 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  32.61 
 
 
421 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  33.86 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  33.86 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  33.8 
 
 
410 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  27.59 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  30.77 
 
 
423 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  31.23 
 
 
400 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  30.21 
 
 
435 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  32.68 
 
 
425 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  30.24 
 
 
432 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  30.29 
 
 
427 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  27.85 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  27.85 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  27.97 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  32.01 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  27.35 
 
 
431 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  28.25 
 
 
462 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  33.58 
 
 
399 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  27.31 
 
 
542 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.36 
 
 
393 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  28.44 
 
 
418 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.27 
 
 
427 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.27 
 
 
427 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  29.43 
 
 
360 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  26.91 
 
 
398 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  26.04 
 
 
406 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  26.65 
 
 
388 aa  97.8  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.41 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  27.71 
 
 
441 aa  90.1  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.38 
 
 
477 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.65 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.89 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.74 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.71 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.36 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.38 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.01 
 
 
476 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.19 
 
 
379 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.09 
 
 
506 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.59 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.72 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.04 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  23.7 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  26.67 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  26.7 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.52 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.36 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.21 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  35.85 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  24.36 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  23.38 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  26.93 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.82 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  24.42 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.62 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  23.62 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.43 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.6 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.47 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  25.89 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.71 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  23.77 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.11 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24.93 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  22.28 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  25.06 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.26 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  23.64 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  26.43 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  24 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.58 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  23.55 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.8 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  22.44 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>