73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0196 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  862    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  45.43 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  38.43 
 
 
445 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  30.37 
 
 
398 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  29.3 
 
 
418 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  26.16 
 
 
406 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  27.8 
 
 
399 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  27.36 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  25.13 
 
 
396 aa  90.1  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  27.92 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  22.2 
 
 
466 aa  89.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  23.99 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  28.02 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  25 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  25.68 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  27.57 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  25.68 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  27.91 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  27.73 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  27.63 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  24.61 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  24.06 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  26.69 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.06 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  26.93 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  25.98 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  22.56 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  23.52 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.78 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  22.56 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.33 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  24.11 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25.8 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  28.74 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  24.54 
 
 
462 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  19.25 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  22.6 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.5 
 
 
379 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  26.57 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  26.57 
 
 
471 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.83 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.5 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  25.23 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  23.54 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  24.44 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  24.12 
 
 
425 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  24.26 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.26 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  23.26 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.17 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  22.95 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  21.97 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  20.51 
 
 
477 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  22.27 
 
 
393 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  24.61 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.5 
 
 
360 aa  53.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  22.78 
 
 
403 aa  53.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  21.04 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  20.8 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  20.82 
 
 
400 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  23.98 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  25.88 
 
 
429 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  21.03 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  19.56 
 
 
416 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  21.96 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.44 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  23.08 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.08 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  28.31 
 
 
339 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  19.95 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  21.14 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  25.71 
 
 
196 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  26.86 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>