174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2955 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  100 
 
 
416 aa  835    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  69.71 
 
 
418 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  67.55 
 
 
415 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  68.36 
 
 
415 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  49.51 
 
 
412 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  46.08 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  44.36 
 
 
406 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  44.12 
 
 
406 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  43.34 
 
 
412 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  44.04 
 
 
406 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  43.1 
 
 
412 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  43.89 
 
 
417 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  44.36 
 
 
416 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  42.47 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  36.54 
 
 
426 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  40.71 
 
 
430 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  35.95 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  37.29 
 
 
454 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  34.53 
 
 
415 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  37.15 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  35.81 
 
 
425 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  37.07 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.71 
 
 
391 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  33.95 
 
 
380 aa  206  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.22 
 
 
394 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  33.99 
 
 
385 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  35.22 
 
 
389 aa  203  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  35.2 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  34.79 
 
 
402 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.96 
 
 
386 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  35.4 
 
 
407 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  31.84 
 
 
418 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  34.47 
 
 
409 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  34.8 
 
 
339 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  34.29 
 
 
386 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  32.18 
 
 
392 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  31.65 
 
 
421 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  31.91 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  30.43 
 
 
408 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  32.32 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  32.15 
 
 
409 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  29.79 
 
 
426 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  34.17 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  35.91 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  30.79 
 
 
388 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  27.53 
 
 
408 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  32.13 
 
 
392 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  31.58 
 
 
392 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  30.17 
 
 
394 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  29.41 
 
 
388 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  29.34 
 
 
390 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  29.92 
 
 
383 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  30.17 
 
 
388 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  33.24 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  30.81 
 
 
380 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  30.39 
 
 
387 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  32.32 
 
 
402 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  33.05 
 
 
390 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30.41 
 
 
441 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  30.88 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  29.09 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  27.82 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  29.95 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  30.42 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  28.17 
 
 
384 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  30.53 
 
 
408 aa  126  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  30.66 
 
 
426 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  30.75 
 
 
389 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  29.48 
 
 
424 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.91 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  31.36 
 
 
389 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  30.62 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.58 
 
 
425 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  28.93 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  28.93 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  29.93 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25.14 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.87 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  31.39 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.51 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  29 
 
 
427 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.9 
 
 
379 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.58 
 
 
402 aa  104  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.72 
 
 
378 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.84 
 
 
380 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.91 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.88 
 
 
427 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  26.12 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.9 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.3 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  25.5 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  29.89 
 
 
229 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.21 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  27.43 
 
 
350 aa  94.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.21 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.47 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.45 
 
 
476 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  28.24 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  27.76 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  26.65 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>