87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1326 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  905    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  38.43 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  36.66 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  29.37 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  28.19 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  29.32 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  29.09 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  26.45 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.45 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  26.29 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.86 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  25.25 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  25.25 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.59 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  23.53 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  26.18 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  22.71 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  26.61 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  27.41 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  24.39 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  23.08 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  21.27 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.27 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  27.53 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  22.94 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  22.8 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.57 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  25.78 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.58 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  25.06 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.75 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  25.07 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  25 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  27.11 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.32 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  25.21 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  25.53 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  24.3 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  25.15 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.28 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  23.98 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.06 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  22.69 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  21.43 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.49 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.49 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.91 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.61 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.08 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  25.3 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  21.75 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.17 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.3 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.91 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  25.88 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  23.88 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.31 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.95 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  25.44 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.32 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  23.03 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  22.61 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0142  putative AAA+ superfamily ATPase  27.22 
 
 		 159 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.085374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  21.76 
 
 		 542 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.04 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  22.55 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  22.84 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  22.39 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  21.54 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  25.45 
 
 		 339 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  21.71 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  23.6 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  20.8 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  22.4 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  22.22 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  25.4 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  24.89 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  26.51 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  23.55 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  25.79 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  22.92 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  21.86 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>