170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0409 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  95.51 
 
 
423 aa  810    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  89.36 
 
 
423 aa  764    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  92.43 
 
 
423 aa  785    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  837    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  38.89 
 
 
427 aa  289  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  35.12 
 
 
428 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  34.19 
 
 
428 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  35.35 
 
 
427 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  39.12 
 
 
430 aa  257  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  34.94 
 
 
431 aa  241  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  31.88 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  35.34 
 
 
430 aa  219  5e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  33.02 
 
 
403 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  31.35 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  33.25 
 
 
435 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  30.46 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  30.99 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  30.6 
 
 
410 aa  196  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  29.23 
 
 
437 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  30.9 
 
 
413 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  31.67 
 
 
427 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  33.17 
 
 
423 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  31.42 
 
 
431 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  31.58 
 
 
420 aa  190  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  30.7 
 
 
421 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  30.05 
 
 
415 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  30.3 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  31.5 
 
 
471 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  30.3 
 
 
417 aa  182  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  31.5 
 
 
426 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  32.73 
 
 
417 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  30.79 
 
 
429 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  32.27 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 
413 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  27.18 
 
 
400 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  31.46 
 
 
410 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  30.88 
 
 
431 aa  156  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  25.68 
 
 
542 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  31.57 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  27.16 
 
 
424 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  27.16 
 
 
428 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  30.95 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  27.87 
 
 
427 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  29.34 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  29.12 
 
 
388 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  29.01 
 
 
418 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  28.49 
 
 
392 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.86 
 
 
393 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  28.74 
 
 
441 aa  106  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.44 
 
 
386 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.18 
 
 
382 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  33.93 
 
 
196 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  26.86 
 
 
445 aa  101  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  26.78 
 
 
434 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.4 
 
 
485 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.88 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.77 
 
 
486 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  27.11 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.16 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.93 
 
 
425 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  23.84 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  27.57 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  24.41 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  24.53 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.45 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.15 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  22.95 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.39 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  23.25 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  26.27 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.18 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.18 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.92 
 
 
390 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  22.44 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  23.88 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  22.99 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  24.58 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.1 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  23.46 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.08 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.7 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  21.77 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  22.33 
 
 
486 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  22.25 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  25 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  22.47 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.39 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  25.21 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.5 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  22.29 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  22 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  24.11 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  24.52 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  23.72 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.17 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  22.22 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  22.98 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  23.05 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  26.59 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.08 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>