169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1959 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  796    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  44.85 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  42.78 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  41.3 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  41.29 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  43.12 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  40.52 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  41.04 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  42.05 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  42.34 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  39.48 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  40.63 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  40.42 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  43.01 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  39.78 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  41.73 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  39.84 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  41.73 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  39.58 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  39.27 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.86 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  35.35 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  34.05 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  34.93 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  35.37 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  31.23 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.39 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.72 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.92 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  34.94 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  34.58 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  34.02 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  29.68 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  29.22 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  31.78 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  32.52 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  27.88 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  28.97 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  28.97 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  30.6 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  32.3 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  33.89 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  29.63 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  28.34 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  29.1 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  28.61 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29.36 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  29.49 
 
 		 436 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  29.81 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  28.37 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  29.12 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  28.76 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  29.13 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  28.23 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.62 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  29.16 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.15 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.41 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  27.52 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.81 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  25.61 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.4 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  26.03 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  27.9 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  27.25 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.44 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  30.25 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.24 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  27.61 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  27.61 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  25.75 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  26.29 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.73 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  25.73 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  26.85 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  44.03 
 
 		 139 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  27.11 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.23 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.49 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.13 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.16 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  29.22 
 
 		 229 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.43 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  26.5 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  40.54 
 
 		 135 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.07 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  26.99 
 
 		 454 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.6 
 
 		 476 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  26.43 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  25.29 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  24.56 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.6 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.93 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.07 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.08 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  28.14 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.04 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.72 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>