80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2492 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  100 
 
 
542 aa  1122    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  52.51 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  32.62 
 
 
466 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  30.45 
 
 
427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  28.38 
 
 
431 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  30.63 
 
 
431 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  30.63 
 
 
420 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  30.57 
 
 
428 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  30.18 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  28.57 
 
 
428 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  30.15 
 
 
403 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  29.2 
 
 
427 aa  160  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  25.68 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  29.06 
 
 
471 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.34 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  29.06 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.11 
 
 
423 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  28.36 
 
 
415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.94 
 
 
423 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  28.75 
 
 
431 aa  140  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  29.01 
 
 
430 aa  139  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  28.15 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  29.56 
 
 
423 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  27.36 
 
 
417 aa  130  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  27.87 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.82 
 
 
421 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  27.53 
 
 
410 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  26.53 
 
 
427 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  26.88 
 
 
428 aa  121  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  26.88 
 
 
424 aa  121  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  26.65 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  27.9 
 
 
427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  27.6 
 
 
434 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  27.31 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  29.24 
 
 
417 aa  114  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  26.1 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  25.29 
 
 
413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  25.14 
 
 
399 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  27.69 
 
 
410 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.74 
 
 
400 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.51 
 
 
425 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  25.52 
 
 
413 aa  106  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.29 
 
 
435 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  29.57 
 
 
393 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  25.82 
 
 
398 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  24.52 
 
 
418 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
413 aa  97.1  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.64 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.79 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.57 
 
 
476 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  30.91 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.73 
 
 
486 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  22.83 
 
 
377 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  34.06 
 
 
481 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  26.03 
 
 
486 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.03 
 
 
433 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  24.23 
 
 
392 aa  60.8  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  32.12 
 
 
543 aa  60.5  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  32.12 
 
 
543 aa  60.5  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.71 
 
 
360 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  22.07 
 
 
396 aa  60.1  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.72 
 
 
477 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.51 
 
 
506 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  21.8 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.62 
 
 
390 aa  57.4  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.24 
 
 
487 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  22.51 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  23.05 
 
 
465 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  21.76 
 
 
445 aa  52.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  30.07 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.63 
 
 
427 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.63 
 
 
427 aa  47.4  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  22.35 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  23.06 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.63 
 
 
485 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.35 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  22.44 
 
 
398 aa  44.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  22.44 
 
 
419 aa  44.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.09 
 
 
474 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  21.67 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>