147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0220 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  97.54 
 
 
406 aa  823    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  988    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  57.62 
 
 
421 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  53.94 
 
 
409 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  50.12 
 
 
408 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  46.65 
 
 
409 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  42.54 
 
 
408 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  41.38 
 
 
418 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  41.83 
 
 
391 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  38.44 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  40.11 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  39.04 
 
 
385 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  36.06 
 
 
394 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  37.12 
 
 
392 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  35.05 
 
 
389 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  33.87 
 
 
380 aa  225  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  36.15 
 
 
386 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  35.57 
 
 
402 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  36.49 
 
 
392 aa  217  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.6 
 
 
386 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  33.81 
 
 
339 aa  209  9e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  34.1 
 
 
406 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  31.95 
 
 
406 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  32.08 
 
 
406 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  32.42 
 
 
417 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  29.68 
 
 
411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  34.21 
 
 
412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  33.95 
 
 
412 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.75 
 
 
418 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  31.78 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  31.77 
 
 
415 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  33.79 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  32.07 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  28.23 
 
 
416 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29 
 
 
415 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  32.58 
 
 
413 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  28.78 
 
 
454 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  29.8 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  30.09 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  29.9 
 
 
383 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  31.61 
 
 
388 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  36.73 
 
 
259 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  29.65 
 
 
390 aa  144  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  27.67 
 
 
412 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  31.5 
 
 
380 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.54 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  29.12 
 
 
388 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  28.94 
 
 
383 aa  136  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  29.57 
 
 
441 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  30.97 
 
 
415 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.76 
 
 
425 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  31.14 
 
 
392 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  27.62 
 
 
394 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  27.75 
 
 
388 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  35.15 
 
 
229 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  28.61 
 
 
394 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  27.57 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  46.34 
 
 
135 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  26.61 
 
 
426 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  25.44 
 
 
407 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  25.27 
 
 
390 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.56 
 
 
376 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  27.87 
 
 
378 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  26.58 
 
 
391 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  26.57 
 
 
390 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  27.79 
 
 
350 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.72 
 
 
419 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.72 
 
 
398 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  27.6 
 
 
390 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.1 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  27.08 
 
 
387 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.45 
 
 
269 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  26.37 
 
 
402 aa  97.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.16 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25.58 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.96 
 
 
402 aa  90.9  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.05 
 
 
378 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  27.14 
 
 
389 aa  86.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  25.97 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.31 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.29 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.29 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.55 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  24.18 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.5 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  22.7 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  22.7 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  24.6 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.75 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  22.62 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.67 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.67 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.4 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  21.43 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  24.19 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0673  hypothetical protein  37.29 
 
 
136 aa  67  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0778  hypothetical protein  37.29 
 
 
136 aa  67  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.333717  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  23.73 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  23.53 
 
 
481 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>