177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2828 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 		 485 aa  1009    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  49.15 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  48.12 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  36.33 
 
 		 506 aa  326  7e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  29.11 
 
 		 477 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  27.82 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  29.75 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  28.25 
 
 		 481 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  27.9 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  26.88 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.77 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.22 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.8 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  22.69 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.79 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.21 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  23.12 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  24.65 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.4 
 
 		 423 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  22.76 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  23.24 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  24.56 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  24.09 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 413 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.65 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  22.41 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  22.41 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  25.71 
 
 		 406 aa  89.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.54 
 
 		 414 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  23.96 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  26.88 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  24.66 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  24.66 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  23.37 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2288  AAA ATPase  26.69 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  25.54 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  22.41 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  26.87 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  34.48 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  34.48 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  26.44 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  24.56 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.68 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  22.43 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  26.46 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.68 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  23.45 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  26.01 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  25 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  22.61 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  25.78 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  27.46 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  24.64 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.42 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.98 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  21.8 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.59 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  22.7 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  23.1 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.82 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.39 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  26.55 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  22.52 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  21.86 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  26.7 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  25.13 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  23.72 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  22.62 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.36 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.36 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  27.48 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  23.65 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  25.08 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  22.22 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  23.1 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  26.22 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  23.4 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  24.7 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  24.43 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  25.67 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24.5 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  23.24 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  22.17 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  23.38 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.73 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  21.91 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  22.35 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  23.06 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.92 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  23.65 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.24 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  22.13 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  21.78 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  25.21 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  25.18 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  23.62 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  24.57 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  23.18 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>