110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3607 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  888    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  41.03 
 
 
429 aa  322  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  34.79 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  33.83 
 
 
471 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  33.83 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  34.04 
 
 
423 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  32.94 
 
 
414 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  32.99 
 
 
403 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  32.79 
 
 
427 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  30.94 
 
 
428 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  31.22 
 
 
428 aa  170  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  29.25 
 
 
425 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  32.85 
 
 
437 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  31.2 
 
 
431 aa  166  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  30.69 
 
 
427 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  29.09 
 
 
428 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  29.09 
 
 
424 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  29.58 
 
 
432 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  31.41 
 
 
431 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  29.38 
 
 
413 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  31.17 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  28.24 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  29.14 
 
 
430 aa  131  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 
413 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  28.81 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  27.97 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  29.59 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  29.59 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  28.47 
 
 
417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  27.6 
 
 
542 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  25.87 
 
 
417 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  27.3 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  26.17 
 
 
466 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  28.01 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  28.23 
 
 
410 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  27.7 
 
 
410 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  29.72 
 
 
360 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25 
 
 
400 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.78 
 
 
423 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  25.97 
 
 
399 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  26.54 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.86 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  26.49 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.94 
 
 
388 aa  93.2  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  25.99 
 
 
462 aa  90.5  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  27.4 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.84 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.71 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.23 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.95 
 
 
506 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  26.03 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  25.84 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  24.34 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  22.86 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  23.45 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  23.76 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  32.85 
 
 
196 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  22.35 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  24.77 
 
 
481 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.2 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  24.72 
 
 
448 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  23.33 
 
 
425 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24 
 
 
486 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.26 
 
 
477 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.06 
 
 
485 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  25.68 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  24.23 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.82 
 
 
477 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  24.28 
 
 
396 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  24.44 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  24.86 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  27.93 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  22.56 
 
 
388 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  22.12 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.53 
 
 
380 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  23.18 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  23.18 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  23.53 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  26.4 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  26.4 
 
 
435 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  22.29 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  27.44 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  22.29 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  23.1 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  22.02 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  28.78 
 
 
543 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  28.78 
 
 
543 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  24.18 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  22.04 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  23.32 
 
 
406 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  24.91 
 
 
458 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.45 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.34 
 
 
386 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  22.4 
 
 
445 aa  46.6  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  22.19 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.12 
 
 
376 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  20.77 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2973  AAA ATPase  21.28 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  23.99 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>