177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3330 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  100 
 
 		 386 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  50.79 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  50.27 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  50.13 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  48.27 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  49.35 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  50.14 
 
 		 380 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  51.05 
 
 		 339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  45.09 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  45.45 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  45.55 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  44.21 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  44.42 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  39.56 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  36.41 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  36.56 
 
 		 409 aa  239  8e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  35.96 
 
 		 406 aa  225  9e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  36.15 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  35.07 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  33.79 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  32.51 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  43.23 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  33.25 
 
 		 408 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  33.42 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  32.61 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  34.22 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  34.38 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  33.98 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  33.68 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  31.33 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  31.78 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  31.33 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  33.16 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  33.71 
 
 		 415 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  32.83 
 
 		 454 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  33.78 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  33.14 
 
 		 411 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  29.59 
 
 		 416 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  34.03 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  32.32 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  34.58 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  32.17 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  32.49 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  32.47 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  30.95 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  32.34 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  30.82 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  29.08 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  38.6 
 
 		 229 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  29.08 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  32.06 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  30.9 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  29.97 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  31.33 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.65 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  31.99 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  29.41 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  32.53 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  32.63 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  29.74 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  32.22 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  31.75 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  31.61 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  31.69 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  25.96 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  29.61 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  51.28 
 
 		 135 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  29.49 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30.84 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.57 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  26.63 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  26.39 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  30.18 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  29 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  29 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  28.2 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.07 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.8 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  27.33 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  29.2 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  31.66 
 
 		 269 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.12 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.12 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25.86 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3441  AAA family ATPase  66.2 
 
 		 81 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.21 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.7 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.78 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  22.61 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  26.75 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  27.95 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  26.07 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  23.51 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.5 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  28.17 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  26.25 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  25.21 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  23.49 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  22.53 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  23.74 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>