153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10609 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  809    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  48.27 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  42.13 
 
 
406 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  40.87 
 
 
454 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  41.38 
 
 
418 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  40.59 
 
 
406 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  41.56 
 
 
415 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  43.07 
 
 
406 aa  289  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  42.57 
 
 
407 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  40.53 
 
 
416 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  42.47 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  39.16 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  41.56 
 
 
417 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  39.41 
 
 
412 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  39.41 
 
 
412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  41.81 
 
 
415 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  39 
 
 
436 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  33.97 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  33.57 
 
 
415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  48.8 
 
 
269 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.87 
 
 
391 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  31.26 
 
 
425 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  35.64 
 
 
388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  29.68 
 
 
474 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  33.25 
 
 
407 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  29.31 
 
 
418 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.88 
 
 
409 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29.81 
 
 
409 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  32.87 
 
 
392 aa  176  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  33.14 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  28.68 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  35.93 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  28.65 
 
 
392 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  30 
 
 
339 aa  170  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  28.5 
 
 
380 aa  169  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.39 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.99 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.79 
 
 
394 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  30.13 
 
 
389 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.89 
 
 
386 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  31 
 
 
388 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  26.15 
 
 
408 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  29.31 
 
 
413 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  28.93 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
392 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  30.24 
 
 
394 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  29.66 
 
 
412 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  30.33 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  32.38 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  32.81 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  30.75 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  28.29 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  31.89 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  28.81 
 
 
391 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  30.05 
 
 
424 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  29.81 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  28.16 
 
 
384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  30.34 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  30.11 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  26.03 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  27.43 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  31.01 
 
 
426 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  28.88 
 
 
390 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  31.32 
 
 
441 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  28.57 
 
 
390 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.25 
 
 
393 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  25.94 
 
 
419 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.94 
 
 
398 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  27.4 
 
 
378 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  28.65 
 
 
380 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  31.61 
 
 
229 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.06 
 
 
376 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.18 
 
 
376 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  31.62 
 
 
417 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  27.48 
 
 
383 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.27 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  28.92 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  30.47 
 
 
389 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  25.34 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.09 
 
 
423 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.93 
 
 
259 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  28.06 
 
 
427 aa  94  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.78 
 
 
382 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  29.03 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.45 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.64 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  27.16 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  27.84 
 
 
417 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  24.66 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.51 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  27.42 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  27.7 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  26.97 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.03 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  27.1 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  26.61 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.22 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  26.46 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  24.16 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>