183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3726 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  100 
 
 
385 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  47.14 
 
 
385 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  44.5 
 
 
388 aa  359  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  43.72 
 
 
391 aa  349  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  44.27 
 
 
394 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  43.04 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  43.12 
 
 
392 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  42.71 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  41.69 
 
 
402 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  41.76 
 
 
386 aa  324  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  44.42 
 
 
386 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  42.74 
 
 
380 aa  310  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  39.62 
 
 
418 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  44.7 
 
 
339 aa  272  7e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  38.93 
 
 
409 aa  262  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  38.83 
 
 
408 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  38.83 
 
 
406 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  39.04 
 
 
474 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  36.6 
 
 
421 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  35.28 
 
 
408 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  32.28 
 
 
409 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  40.43 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  29.61 
 
 
418 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  32.97 
 
 
416 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  31.18 
 
 
415 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  30.87 
 
 
415 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  30.51 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  30.77 
 
 
412 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  32.85 
 
 
388 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  28.18 
 
 
406 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  50 
 
 
229 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  28.02 
 
 
406 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  30.57 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  29.21 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  28.99 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  29.68 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  29.26 
 
 
417 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  30.57 
 
 
388 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  30.88 
 
 
383 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  28.3 
 
 
406 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  27.01 
 
 
416 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  28.24 
 
 
426 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  32.13 
 
 
384 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  29.27 
 
 
407 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.65 
 
 
425 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  29.02 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  30.26 
 
 
392 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  30.51 
 
 
380 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  30 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.43 
 
 
415 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  28.95 
 
 
413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  28.96 
 
 
392 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  27.97 
 
 
390 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  28.53 
 
 
394 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30 
 
 
441 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  29.76 
 
 
402 aa  132  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  28.24 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  25.32 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  27.61 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  28.41 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.95 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  52.07 
 
 
135 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  25.65 
 
 
430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  28.85 
 
 
387 aa  126  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  27.35 
 
 
390 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  29.53 
 
 
389 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  26.53 
 
 
394 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  29.64 
 
 
389 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.53 
 
 
376 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  23.91 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.83 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.56 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  28.7 
 
 
427 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  28.7 
 
 
427 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  26.56 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  26.86 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  27.54 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.81 
 
 
377 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.51 
 
 
376 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.71 
 
 
382 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.42 
 
 
378 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  24.8 
 
 
398 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  24.86 
 
 
419 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.79 
 
 
414 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.86 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.53 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.79 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3441  AAA family ATPase  60.56 
 
 
81 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  23.74 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.86 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  24.34 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  26.46 
 
 
269 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.08 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  21.31 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  23.75 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.87 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  24.55 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  22.53 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  23.88 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.18 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>