83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1709 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  81.08 
 
 
408 aa  651    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  64.29 
 
 
426 aa  507  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  57.68 
 
 
423 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  54.95 
 
 
425 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  53.81 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  53.66 
 
 
423 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  37.06 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  35.98 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  34.88 
 
 
417 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  33.41 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  33.98 
 
 
402 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  32.79 
 
 
427 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  31.99 
 
 
436 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  29.38 
 
 
416 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  30.99 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  30.96 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  30.28 
 
 
415 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  27.97 
 
 
406 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.02 
 
 
418 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  30.73 
 
 
416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  29.66 
 
 
406 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  29.07 
 
 
406 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  30.1 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.1 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  28.4 
 
 
407 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  25.99 
 
 
412 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.74 
 
 
425 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  31.62 
 
 
430 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  25.47 
 
 
412 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  25.23 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  26.14 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  25.07 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  25.4 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.84 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  27.91 
 
 
389 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  24.26 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  27.21 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.87 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  24.34 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.99 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.93 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  26.52 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.06 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  26.17 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  24.22 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  27.37 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  26.02 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.39 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  29.26 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.98 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  26.25 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  23.89 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  24.34 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.57 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  26.65 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.02 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  23.72 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  26 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  25.74 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  26.21 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  24.11 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  24.14 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.75 
 
 
474 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  25.06 
 
 
426 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  25.26 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  26.34 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  25.82 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  24.73 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.4 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  23.4 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  25.35 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  28.06 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  28.06 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  25.29 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.9 
 
 
259 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  22.34 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  26.79 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  25.57 
 
 
413 aa  47  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  23.16 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0948  ATPase  34.29 
 
 
109 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.789039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  31.58 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>