88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0506 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  830    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  53.83 
 
 
417 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  41.19 
 
 
427 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  35.39 
 
 
425 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  35.89 
 
 
402 aa  222  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  34.88 
 
 
424 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  33.98 
 
 
408 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.8 
 
 
425 aa  189  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.49 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  34.03 
 
 
424 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  34.19 
 
 
426 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  33.03 
 
 
423 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  29.31 
 
 
418 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  29.24 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  29.88 
 
 
416 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  28.33 
 
 
415 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  29.63 
 
 
412 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  27.92 
 
 
407 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  27.65 
 
 
409 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  28.01 
 
 
425 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  27.97 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  29.79 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.3 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.5 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  26.87 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  27.84 
 
 
411 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  25.77 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.45 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  27.93 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  28.61 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  26.06 
 
 
412 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.32 
 
 
454 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  25.25 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  24.86 
 
 
408 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.48 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.36 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  26.07 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  29.06 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.93 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  28.9 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  26.45 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  28.14 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  27.17 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  26.3 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  27.73 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.03 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  26.36 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  28.34 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  27.87 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  25.47 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  26.79 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  26.3 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  23.2 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  27.5 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  26.89 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  23.4 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  22.98 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.63 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.38 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.93 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.11 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.06 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  24.82 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  26.03 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.85 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  26.67 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.92 
 
 
406 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  24.51 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  24.51 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  25.61 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  27.38 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  22.49 
 
 
477 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.74 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  28.14 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  26.38 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  26.18 
 
 
426 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.29 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  23.28 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  22.4 
 
 
474 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  24.46 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  25.77 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  22.98 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  26.33 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  28.77 
 
 
269 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  24.5 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.91 
 
 
485 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.55 
 
 
487 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  23.5 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>