145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12040 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  874    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  54.13 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  54.13 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  50.54 
 
 
380 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  46.49 
 
 
384 aa  331  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  43.38 
 
 
394 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  47.92 
 
 
350 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  46.23 
 
 
390 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  40.41 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  45.45 
 
 
390 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  44.62 
 
 
391 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  44.33 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  42.89 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  42.47 
 
 
394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  42.93 
 
 
389 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  41.82 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  42.67 
 
 
389 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  40.22 
 
 
392 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  40.17 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  38.21 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
392 aa  230  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  30.75 
 
 
412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.53 
 
 
391 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.3 
 
 
418 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  32.42 
 
 
415 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  30.3 
 
 
406 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  30.25 
 
 
415 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30.3 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.18 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  30.23 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  33.88 
 
 
388 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  29.18 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  30.1 
 
 
418 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  31.09 
 
 
407 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  29.65 
 
 
385 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  31.94 
 
 
402 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  26.08 
 
 
408 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.86 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.6 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  30.54 
 
 
417 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  32 
 
 
339 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  30.48 
 
 
416 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  29.11 
 
 
406 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  32.64 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  29.56 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  29.95 
 
 
418 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  29.94 
 
 
474 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  31.98 
 
 
392 aa  136  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.59 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  33.82 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  28.88 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  30.67 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  28.45 
 
 
409 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  28.78 
 
 
416 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  28.74 
 
 
425 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  29.91 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  28.24 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  28.5 
 
 
412 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  29.56 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  31.06 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.38 
 
 
408 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.85 
 
 
390 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  27.96 
 
 
413 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  49.18 
 
 
139 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  28.53 
 
 
378 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  28.03 
 
 
407 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.11 
 
 
378 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.81 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.12 
 
 
426 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.87 
 
 
376 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25 
 
 
427 aa  90.5  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.79 
 
 
377 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.49 
 
 
415 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  27.06 
 
 
454 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.91 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  23.82 
 
 
436 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.67 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.91 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  26.09 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.16 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  33.55 
 
 
229 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.22 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  27.11 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.62 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.32 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.34 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  27.86 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  21.51 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  25.63 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  23.26 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  24.85 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.19 
 
 
135 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.94 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  23.93 
 
 
413 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  24.38 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  23.93 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.71 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.13 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>