163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3175 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  100 
 
 		 415 aa  856    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  53.64 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  38.5 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  38.41 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  39.28 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  37.92 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  38.5 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  37.44 
 
 		 406 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  37.47 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  34.06 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  35.97 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  37.44 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  37.21 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  33.97 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  36.53 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  33.57 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  33.82 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  34.92 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  35.08 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  31.48 
 
 		 418 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  32.02 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  32.72 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  30.98 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  32.64 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  30.46 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  29.77 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  31.16 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  30.91 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  30.77 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  28.17 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  27.43 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  29.08 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  28.95 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.43 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.14 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.55 
 
 		 391 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  30.18 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  31.36 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.47 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  30.68 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  30.1 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  29.85 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  30.97 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  29.62 
 
 		 392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  27.96 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  27.71 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  27.21 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  30.3 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  30.3 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  28.49 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  29.1 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.85 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  26.54 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.25 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  28.47 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  26.39 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  28.99 
 
 		 394 aa  107  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.49 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  29.12 
 
 		 392 aa  106  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.39 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.36 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  26.85 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.37 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.37 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  28.8 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  27.12 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  27.33 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  25.89 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  28.18 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  28.18 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  28.11 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  31.67 
 
 		 229 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  26.61 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.39 
 
 		 259 aa  93.2  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  30.65 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  28.5 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  25.89 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  26.47 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  28.03 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.74 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.41 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  26.33 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  25.39 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  25 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  24.11 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  26.85 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.89 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.79 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  25.84 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  23.43 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.75 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  25.18 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.63 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.42 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.66 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  25.65 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.36 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.53 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  26.05 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  28.25 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>