114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1351 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  43.37 
 
 
388 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  50 
 
 
385 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  47.98 
 
 
391 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  39.06 
 
 
380 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  42.71 
 
 
389 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  44.77 
 
 
386 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  39.02 
 
 
392 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  38.6 
 
 
386 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  44 
 
 
385 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  35.35 
 
 
392 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  39.27 
 
 
259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  39.23 
 
 
394 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  39.89 
 
 
339 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  39.27 
 
 
402 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  40.11 
 
 
418 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  40.76 
 
 
421 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  42.04 
 
 
408 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  36.93 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  38.85 
 
 
406 aa  121  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  35.15 
 
 
474 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  35.14 
 
 
409 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  32.8 
 
 
408 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  47.75 
 
 
135 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  31.61 
 
 
411 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  29.69 
 
 
412 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  30.21 
 
 
412 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  32.35 
 
 
413 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  34.13 
 
 
394 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  29.94 
 
 
412 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  28.95 
 
 
416 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  31.02 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  30 
 
 
406 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  32.98 
 
 
388 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  31.67 
 
 
415 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  30.41 
 
 
436 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  32.07 
 
 
426 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  33.73 
 
 
387 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  29.48 
 
 
406 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  32.53 
 
 
394 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  31.18 
 
 
402 aa  95.5  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  29.22 
 
 
388 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30.77 
 
 
406 aa  95.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  28.37 
 
 
412 aa  94.7  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  37.91 
 
 
390 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.98 
 
 
426 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  29 
 
 
430 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  32.93 
 
 
350 aa  91.7  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  34.42 
 
 
390 aa  91.7  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  36.6 
 
 
390 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  31.95 
 
 
380 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  36.78 
 
 
391 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  33.12 
 
 
384 aa  89  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  28.74 
 
 
407 aa  89  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  30.62 
 
 
382 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  27.56 
 
 
418 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  29.05 
 
 
392 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  28.74 
 
 
415 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  35.54 
 
 
389 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  32.45 
 
 
383 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  30.62 
 
 
386 aa  85.1  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  34.94 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  29.89 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  27.23 
 
 
417 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  29.41 
 
 
382 aa  82  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  30.46 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  31.14 
 
 
390 aa  79  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  29.01 
 
 
427 aa  79  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  29.01 
 
 
427 aa  79  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  33.55 
 
 
441 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  29.61 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  28.74 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  29.17 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  26.42 
 
 
454 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  23.78 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  32.99 
 
 
380 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.59 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.75 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.23 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  23.27 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.53 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  25 
 
 
425 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  28.74 
 
 
477 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.11 
 
 
423 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  22.73 
 
 
407 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.65 
 
 
402 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  30.32 
 
 
418 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.22 
 
 
423 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  25.22 
 
 
423 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  24.2 
 
 
410 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.78 
 
 
423 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  25.16 
 
 
392 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  25.87 
 
 
462 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  21.51 
 
 
431 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  26.67 
 
 
424 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  26.67 
 
 
428 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  24.1 
 
 
477 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  22.95 
 
 
393 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  22.65 
 
 
420 aa  48.5  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>